Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ctdspl2Q8BG15 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ctdspl2Q8BG15 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ctdspl2Q8BG15 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ctdspl2Q8BG15 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ctdspl2Q8BG15 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ctdspl2Q8BG15 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ctdspl2Q8BG15 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ctdspl2Q8BG15 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ctdspl2Q8BG15 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ctdspl2Q8BG15 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ctdspl2Q8BG15 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ctdspl2Q8BG15 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ctdspl2Q8BG15 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ctdspl2Q8BG15 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ctdspl2Q8BG15 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ctdspl2Q8BG15 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ctdspl2Q8BG15 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ctdspl2Q8BG15 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ctdspl2Q8BG15 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ctdspl2Q8BG15 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ctdspl2Q8BG15 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ctdspl2Q8BG15 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ctdspl2Q8BG15 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ctdspl2Q8BG15 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ctdspl2Q8BG15 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ctdspl2Q8BG15 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ctdspl2Q8BG15 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ctdspl2Q8BG15 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ctdspl2Q8BG15 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ctdspl2Q8BG15 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ctdspl2Q8BG15 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ctdspl2Q8BG15 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ctdspl2Q8BG15 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ctdspl2Q8BG15 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ctdspl2Q8BG15 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ctdspl2Q8BG15 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ctdspl2Q8BG15 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ctdspl2Q8BG15 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ctdspl2Q8BG15 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ctdspl2Q8BG15 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ctdspl2Q8BG15 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ctdspl2Q8BG15 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ctdspl2Q8BG15 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ctdspl2Q8BG15 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ctdspl2Q8BG15 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ctdspl2Q8BG15 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ctdspl2Q8BG15 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ctdspl2Q8BG15 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ctdspl2Q8BG15 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ctdspl2Q8BG15 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ctdspl2Q8BG15 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ctdspl2Q8BG15 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ctdspl2Q8BG15 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ctdspl2Q8BG15 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ctdspl2Q8BG15 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ctdspl2Q8BG15 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ctdspl2Q8BG15 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ctdspl2Q8BG15 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ctdspl2Q8BG15 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ctdspl2Q8BG15 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ctdspl2Q8BG15 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ctdspl2Q8BG15 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ctdspl2Q8BG15 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ctdspl2Q8BG15 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ctdspl2Q8BG15 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ctdspl2Q8BG15 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ctdspl2Q8BG15 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ctdspl2Q8BG15 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ctdspl2Q8BG15 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ctdspl2Q8BG15 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ctdspl2Q8BG15 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ctdspl2Q8BG15 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ctdspl2Q8BG15 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ctdspl2Q8BG15 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ctdspl2Q8BG15 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ctdspl2Q8BG15 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ctdspl2Q8BG15 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ctdspl2Q8BG15 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ctdspl2Q8BG15 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ctdspl2Q8BG15 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ctdspl2Q8BG15 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ctdspl2Q8BG15 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ctdspl2Q8BG15 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ctdspl2Q8BG15 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ctdspl2Q8BG15 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ctdspl2Q8BG15 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ctdspl2Q8BG15 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ctdspl2Q8BG15 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ctdspl2Q8BG15 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ctdspl2Q8BG15 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ctdspl2Q8BG15 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ctdspl2Q8BG15 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ctdspl2Q8BG15 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ctdspl2Q8BG15 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ctdspl2Q8BG15 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ctdspl2Q8BG15 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ctdspl2Q8BG15 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms