Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFR5

Tufm, Elongation factor Tu, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TufmQ8BFR5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TufmQ8BFR5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TufmQ8BFR5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TufmQ8BFR5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TufmQ8BFR5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TufmQ8BFR5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TufmQ8BFR5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TufmQ8BFR5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TufmQ8BFR5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TufmQ8BFR5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TufmQ8BFR5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TufmQ8BFR5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TufmQ8BFR5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TufmQ8BFR5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TufmQ8BFR5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TufmQ8BFR5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TufmQ8BFR5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TufmQ8BFR5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TufmQ8BFR5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TufmQ8BFR5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TufmQ8BFR5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TufmQ8BFR5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TufmQ8BFR5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TufmQ8BFR5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TufmQ8BFR5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TufmQ8BFR5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TufmQ8BFR5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TufmQ8BFR5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TufmQ8BFR5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TufmQ8BFR5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TufmQ8BFR5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TufmQ8BFR5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TufmQ8BFR5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TufmQ8BFR5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TufmQ8BFR5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TufmQ8BFR5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TufmQ8BFR5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TufmQ8BFR5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TufmQ8BFR5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TufmQ8BFR5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TufmQ8BFR5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TufmQ8BFR5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TufmQ8BFR5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TufmQ8BFR5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TufmQ8BFR5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TufmQ8BFR5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TufmQ8BFR5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TufmQ8BFR5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TufmQ8BFR5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TufmQ8BFR5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TufmQ8BFR5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TufmQ8BFR5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TufmQ8BFR5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TufmQ8BFR5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TufmQ8BFR5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TufmQ8BFR5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TufmQ8BFR5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TufmQ8BFR5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TufmQ8BFR5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TufmQ8BFR5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TufmQ8BFR5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TufmQ8BFR5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TufmQ8BFR5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TufmQ8BFR5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TufmQ8BFR5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TufmQ8BFR5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TufmQ8BFR5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TufmQ8BFR5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TufmQ8BFR5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TufmQ8BFR5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TufmQ8BFR5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TufmQ8BFR5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TufmQ8BFR5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TufmQ8BFR5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TufmQ8BFR5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TufmQ8BFR5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TufmQ8BFR5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TufmQ8BFR5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TufmQ8BFR5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TufmQ8BFR5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TufmQ8BFR5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TufmQ8BFR5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TufmQ8BFR5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TufmQ8BFR5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TufmQ8BFR5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TufmQ8BFR5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TufmQ8BFR5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms