Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD9

Amigo2, Amphoterin-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo2Q80ZD9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Amigo2Q80ZD9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Amigo2Q80ZD9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Amigo2Q80ZD9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Amigo2Q80ZD9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Amigo2Q80ZD9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Amigo2Q80ZD9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Amigo2Q80ZD9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Amigo2Q80ZD9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Amigo2Q80ZD9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Amigo2Q80ZD9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Amigo2Q80ZD9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Amigo2Q80ZD9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Amigo2Q80ZD9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Amigo2Q80ZD9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Amigo2Q80ZD9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Amigo2Q80ZD9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Amigo2Q80ZD9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Amigo2Q80ZD9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Amigo2Q80ZD9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Amigo2Q80ZD9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo2Q80ZD9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo2Q80ZD9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo2Q80ZD9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Amigo2Q80ZD9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Amigo2Q80ZD9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Amigo2Q80ZD9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo2Q80ZD9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo2Q80ZD9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Amigo2Q80ZD9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Amigo2Q80ZD9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Amigo2Q80ZD9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Amigo2Q80ZD9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Amigo2Q80ZD9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Amigo2Q80ZD9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo2Q80ZD9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo2Q80ZD9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Amigo2Q80ZD9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Amigo2Q80ZD9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Amigo2Q80ZD9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Amigo2Q80ZD9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo2Q80ZD9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Amigo2Q80ZD9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Amigo2Q80ZD9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Amigo2Q80ZD9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Amigo2Q80ZD9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Amigo2Q80ZD9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Amigo2Q80ZD9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Amigo2Q80ZD9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Amigo2Q80ZD9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Amigo2Q80ZD9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Amigo2Q80ZD9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Amigo2Q80ZD9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Amigo2Q80ZD9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Amigo2Q80ZD9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo2Q80ZD9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Amigo2Q80ZD9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Amigo2Q80ZD9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Amigo2Q80ZD9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Amigo2Q80ZD9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Amigo2Q80ZD9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Amigo2Q80ZD9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo2Q80ZD9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo2Q80ZD9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Amigo2Q80ZD9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Amigo2Q80ZD9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Amigo2Q80ZD9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo2Q80ZD9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo2Q80ZD9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo2Q80ZD9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Amigo2Q80ZD9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Amigo2Q80ZD9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Amigo2Q80ZD9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Amigo2Q80ZD9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Amigo2Q80ZD9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Amigo2Q80ZD9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Amigo2Q80ZD9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Amigo2Q80ZD9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amigo2Q80ZD9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo2Q80ZD9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo2Q80ZD9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Amigo2Q80ZD9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo2Q80ZD9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo2Q80ZD9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms