Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Negr1Q80Z24 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Negr1Q80Z24 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Negr1Q80Z24 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Negr1Q80Z24 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Negr1Q80Z24 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Negr1Q80Z24 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Negr1Q80Z24 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Negr1Q80Z24 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Negr1Q80Z24 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Negr1Q80Z24 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Negr1Q80Z24 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Negr1Q80Z24 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Negr1Q80Z24 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Negr1Q80Z24 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Negr1Q80Z24 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Negr1Q80Z24 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Negr1Q80Z24 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Negr1Q80Z24 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Negr1Q80Z24 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Negr1Q80Z24 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Negr1Q80Z24 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Negr1Q80Z24 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Negr1Q80Z24 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Negr1Q80Z24 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Negr1Q80Z24 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Negr1Q80Z24 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Negr1Q80Z24 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Negr1Q80Z24 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Negr1Q80Z24 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Negr1Q80Z24 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Negr1Q80Z24 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Negr1Q80Z24 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Negr1Q80Z24 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Negr1Q80Z24 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Negr1Q80Z24 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Negr1Q80Z24 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Negr1Q80Z24 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Negr1Q80Z24 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Negr1Q80Z24 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Negr1Q80Z24 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Negr1Q80Z24 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Negr1Q80Z24 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Negr1Q80Z24 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Negr1Q80Z24 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Negr1Q80Z24 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Negr1Q80Z24 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Negr1Q80Z24 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Negr1Q80Z24 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Negr1Q80Z24 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Negr1Q80Z24 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Negr1Q80Z24 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Negr1Q80Z24 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Negr1Q80Z24 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Negr1Q80Z24 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Negr1Q80Z24 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Negr1Q80Z24 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Negr1Q80Z24 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Negr1Q80Z24 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Negr1Q80Z24 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Negr1Q80Z24 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Negr1Q80Z24 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Negr1Q80Z24 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Negr1Q80Z24 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Negr1Q80Z24 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Negr1Q80Z24 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Negr1Q80Z24 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Negr1Q80Z24 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Negr1Q80Z24 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Negr1Q80Z24 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Negr1Q80Z24 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Negr1Q80Z24 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Negr1Q80Z24 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Negr1Q80Z24 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Negr1Q80Z24 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Negr1Q80Z24 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Negr1Q80Z24 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Negr1Q80Z24 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Negr1Q80Z24 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Negr1Q80Z24 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Negr1Q80Z24 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Negr1Q80Z24 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Negr1Q80Z24 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Negr1Q80Z24 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Negr1Q80Z24 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Negr1Q80Z24 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms