Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Alkbh8Q80Y20 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Alkbh8Q80Y20 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Alkbh8Q80Y20 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Alkbh8Q80Y20 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Alkbh8Q80Y20 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Alkbh8Q80Y20 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Alkbh8Q80Y20 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Alkbh8Q80Y20 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Alkbh8Q80Y20 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Alkbh8Q80Y20 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Alkbh8Q80Y20 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Alkbh8Q80Y20 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Alkbh8Q80Y20 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Alkbh8Q80Y20 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Alkbh8Q80Y20 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Alkbh8Q80Y20 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Alkbh8Q80Y20 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Alkbh8Q80Y20 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Alkbh8Q80Y20 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Alkbh8Q80Y20 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Alkbh8Q80Y20 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Alkbh8Q80Y20 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Alkbh8Q80Y20 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Alkbh8Q80Y20 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Alkbh8Q80Y20 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Alkbh8Q80Y20 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Alkbh8Q80Y20 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Alkbh8Q80Y20 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Alkbh8Q80Y20 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Alkbh8Q80Y20 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alkbh8Q80Y20 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alkbh8Q80Y20 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alkbh8Q80Y20 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Alkbh8Q80Y20 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Alkbh8Q80Y20 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Alkbh8Q80Y20 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alkbh8Q80Y20 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Alkbh8Q80Y20 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Alkbh8Q80Y20 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Alkbh8Q80Y20 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Alkbh8Q80Y20 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alkbh8Q80Y20 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alkbh8Q80Y20 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Alkbh8Q80Y20 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Alkbh8Q80Y20 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Alkbh8Q80Y20 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Alkbh8Q80Y20 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Alkbh8Q80Y20 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Alkbh8Q80Y20 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Alkbh8Q80Y20 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alkbh8Q80Y20 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Alkbh8Q80Y20 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Alkbh8Q80Y20 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Alkbh8Q80Y20 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Alkbh8Q80Y20 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Alkbh8Q80Y20 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Alkbh8Q80Y20 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Alkbh8Q80Y20 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Alkbh8Q80Y20 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Alkbh8Q80Y20 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Alkbh8Q80Y20 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Alkbh8Q80Y20 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Alkbh8Q80Y20 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Alkbh8Q80Y20 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Alkbh8Q80Y20 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Alkbh8Q80Y20 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Alkbh8Q80Y20 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Alkbh8Q80Y20 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Alkbh8Q80Y20 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Alkbh8Q80Y20 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Alkbh8Q80Y20 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Alkbh8Q80Y20 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Alkbh8Q80Y20 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Alkbh8Q80Y20 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Alkbh8Q80Y20 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Alkbh8Q80Y20 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Alkbh8Q80Y20 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Alkbh8Q80Y20 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Alkbh8Q80Y20 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Alkbh8Q80Y20 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Alkbh8Q80Y20 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Alkbh8Q80Y20 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Alkbh8Q80Y20 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Alkbh8Q80Y20 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Alkbh8Q80Y20 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Alkbh8Q80Y20 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Alkbh8Q80Y20 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Alkbh8Q80Y20 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Alkbh8Q80Y20 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Alkbh8Q80Y20 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Alkbh8Q80Y20 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Alkbh8Q80Y20 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Alkbh8Q80Y20 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alkbh8Q80Y20 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alkbh8Q80Y20 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Alkbh8Q80Y20 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Alkbh8Q80Y20 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Alkbh8Q80Y20 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Alkbh8Q80Y20 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms