Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD8

Prap1, Proline-rich acidic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prap1Q80XD8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prap1Q80XD8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prap1Q80XD8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prap1Q80XD8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prap1Q80XD8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prap1Q80XD8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prap1Q80XD8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prap1Q80XD8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Prap1Q80XD8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prap1Q80XD8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prap1Q80XD8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prap1Q80XD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prap1Q80XD8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prap1Q80XD8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prap1Q80XD8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prap1Q80XD8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prap1Q80XD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prap1Q80XD8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prap1Q80XD8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prap1Q80XD8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prap1Q80XD8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prap1Q80XD8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prap1Q80XD8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prap1Q80XD8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prap1Q80XD8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prap1Q80XD8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prap1Q80XD8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prap1Q80XD8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prap1Q80XD8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prap1Q80XD8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prap1Q80XD8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prap1Q80XD8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prap1Q80XD8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prap1Q80XD8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prap1Q80XD8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prap1Q80XD8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prap1Q80XD8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prap1Q80XD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prap1Q80XD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prap1Q80XD8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prap1Q80XD8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prap1Q80XD8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prap1Q80XD8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prap1Q80XD8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prap1Q80XD8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prap1Q80XD8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prap1Q80XD8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prap1Q80XD8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prap1Q80XD8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prap1Q80XD8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prap1Q80XD8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prap1Q80XD8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prap1Q80XD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prap1Q80XD8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prap1Q80XD8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prap1Q80XD8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prap1Q80XD8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prap1Q80XD8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prap1Q80XD8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prap1Q80XD8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prap1Q80XD8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prap1Q80XD8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prap1Q80XD8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prap1Q80XD8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prap1Q80XD8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prap1Q80XD8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prap1Q80XD8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prap1Q80XD8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prap1Q80XD8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prap1Q80XD8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prap1Q80XD8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prap1Q80XD8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prap1Q80XD8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prap1Q80XD8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms