Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ1

Slc22a20, Solute carrier family 22 member 20, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a20Q80UJ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc22a20Q80UJ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc22a20Q80UJ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc22a20Q80UJ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a20Q80UJ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a20Q80UJ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc22a20Q80UJ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc22a20Q80UJ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc22a20Q80UJ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a20Q80UJ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc22a20Q80UJ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc22a20Q80UJ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a20Q80UJ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc22a20Q80UJ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc22a20Q80UJ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc22a20Q80UJ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc22a20Q80UJ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a20Q80UJ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc22a20Q80UJ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc22a20Q80UJ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc22a20Q80UJ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a20Q80UJ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a20Q80UJ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a20Q80UJ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a20Q80UJ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a20Q80UJ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a20Q80UJ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a20Q80UJ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a20Q80UJ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a20Q80UJ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a20Q80UJ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a20Q80UJ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc22a20Q80UJ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a20Q80UJ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a20Q80UJ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a20Q80UJ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a20Q80UJ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a20Q80UJ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc22a20Q80UJ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc22a20Q80UJ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a20Q80UJ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a20Q80UJ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a20Q80UJ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a20Q80UJ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc22a20Q80UJ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc22a20Q80UJ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a20Q80UJ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a20Q80UJ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a20Q80UJ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a20Q80UJ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a20Q80UJ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc22a20Q80UJ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a20Q80UJ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a20Q80UJ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a20Q80UJ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a20Q80UJ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a20Q80UJ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a20Q80UJ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a20Q80UJ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc22a20Q80UJ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc22a20Q80UJ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms