Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rims3Q80U57 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rims3Q80U57 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims3Q80U57 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rims3Q80U57 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims3Q80U57 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims3Q80U57 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rims3Q80U57 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rims3Q80U57 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rims3Q80U57 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims3Q80U57 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims3Q80U57 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims3Q80U57 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims3Q80U57 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims3Q80U57 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rims3Q80U57 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rims3Q80U57 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rims3Q80U57 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rims3Q80U57 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rims3Q80U57 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rims3Q80U57 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rims3Q80U57 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rims3Q80U57 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rims3Q80U57 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rims3Q80U57 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rims3Q80U57 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rims3Q80U57 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rims3Q80U57 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rims3Q80U57 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims3Q80U57 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims3Q80U57 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims3Q80U57 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rims3Q80U57 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims3Q80U57 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rims3Q80U57 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rims3Q80U57 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rims3Q80U57 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims3Q80U57 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims3Q80U57 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rims3Q80U57 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rims3Q80U57 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rims3Q80U57 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims3Q80U57 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rims3Q80U57 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims3Q80U57 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims3Q80U57 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rims3Q80U57 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rims3Q80U57 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rims3Q80U57 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims3Q80U57 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rims3Q80U57 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rims3Q80U57 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims3Q80U57 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rims3Q80U57 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rims3Q80U57 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rims3Q80U57 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rims3Q80U57 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rims3Q80U57 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rims3Q80U57 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rims3Q80U57 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rims3Q80U57 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rims3Q80U57 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rims3Q80U57 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rims3Q80U57 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rims3Q80U57 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims3Q80U57 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims3Q80U57 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rims3Q80U57 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rims3Q80U57 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims3Q80U57 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims3Q80U57 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims3Q80U57 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rims3Q80U57 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rims3Q80U57 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims3Q80U57 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims3Q80U57 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims3Q80U57 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rims3Q80U57 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rims3Q80U57 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims3Q80U57 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims3Q80U57 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rims3Q80U57 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims3Q80U57 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims3Q80U57 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rims3Q80U57 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rims3Q80U57 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims3Q80U57 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms