Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim46Q7TNM2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim46Q7TNM2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim46Q7TNM2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim46Q7TNM2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim46Q7TNM2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim46Q7TNM2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim46Q7TNM2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim46Q7TNM2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim46Q7TNM2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim46Q7TNM2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim46Q7TNM2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim46Q7TNM2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim46Q7TNM2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim46Q7TNM2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim46Q7TNM2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim46Q7TNM2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim46Q7TNM2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim46Q7TNM2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim46Q7TNM2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim46Q7TNM2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim46Q7TNM2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim46Q7TNM2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim46Q7TNM2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim46Q7TNM2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim46Q7TNM2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim46Q7TNM2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim46Q7TNM2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim46Q7TNM2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim46Q7TNM2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim46Q7TNM2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim46Q7TNM2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim46Q7TNM2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim46Q7TNM2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim46Q7TNM2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim46Q7TNM2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim46Q7TNM2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim46Q7TNM2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim46Q7TNM2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim46Q7TNM2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim46Q7TNM2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim46Q7TNM2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim46Q7TNM2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim46Q7TNM2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim46Q7TNM2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim46Q7TNM2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim46Q7TNM2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim46Q7TNM2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim46Q7TNM2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim46Q7TNM2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim46Q7TNM2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim46Q7TNM2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim46Q7TNM2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim46Q7TNM2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim46Q7TNM2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim46Q7TNM2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim46Q7TNM2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim46Q7TNM2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim46Q7TNM2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim46Q7TNM2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim46Q7TNM2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim46Q7TNM2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim46Q7TNM2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim46Q7TNM2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim46Q7TNM2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim46Q7TNM2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim46Q7TNM2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim46Q7TNM2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim46Q7TNM2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim46Q7TNM2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim46Q7TNM2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim46Q7TNM2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim46Q7TNM2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim46Q7TNM2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim46Q7TNM2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim46Q7TNM2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim46Q7TNM2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim46Q7TNM2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim46Q7TNM2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim46Q7TNM2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim46Q7TNM2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim46Q7TNM2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim46Q7TNM2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim46Q7TNM2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim46Q7TNM2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim46Q7TNM2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim46Q7TNM2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms