Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nphp3Q7TNH6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nphp3Q7TNH6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nphp3Q7TNH6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nphp3Q7TNH6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nphp3Q7TNH6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nphp3Q7TNH6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nphp3Q7TNH6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nphp3Q7TNH6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Nphp3Q7TNH6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nphp3Q7TNH6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nphp3Q7TNH6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nphp3Q7TNH6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Nphp3Q7TNH6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nphp3Q7TNH6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nphp3Q7TNH6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nphp3Q7TNH6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nphp3Q7TNH6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nphp3Q7TNH6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nphp3Q7TNH6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nphp3Q7TNH6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nphp3Q7TNH6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nphp3Q7TNH6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nphp3Q7TNH6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nphp3Q7TNH6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nphp3Q7TNH6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nphp3Q7TNH6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nphp3Q7TNH6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nphp3Q7TNH6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Nphp3Q7TNH6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nphp3Q7TNH6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nphp3Q7TNH6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nphp3Q7TNH6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nphp3Q7TNH6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nphp3Q7TNH6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nphp3Q7TNH6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Nphp3Q7TNH6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Nphp3Q7TNH6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nphp3Q7TNH6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nphp3Q7TNH6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nphp3Q7TNH6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nphp3Q7TNH6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nphp3Q7TNH6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nphp3Q7TNH6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nphp3Q7TNH6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nphp3Q7TNH6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nphp3Q7TNH6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nphp3Q7TNH6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nphp3Q7TNH6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nphp3Q7TNH6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nphp3Q7TNH6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nphp3Q7TNH6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nphp3Q7TNH6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nphp3Q7TNH6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nphp3Q7TNH6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nphp3Q7TNH6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Nphp3Q7TNH6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nphp3Q7TNH6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nphp3Q7TNH6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nphp3Q7TNH6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nphp3Q7TNH6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nphp3Q7TNH6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nphp3Q7TNH6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Nphp3Q7TNH6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Nphp3Q7TNH6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nphp3Q7TNH6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Nphp3Q7TNH6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nphp3Q7TNH6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nphp3Q7TNH6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nphp3Q7TNH6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nphp3Q7TNH6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nphp3Q7TNH6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nphp3Q7TNH6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Nphp3Q7TNH6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Nphp3Q7TNH6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nphp3Q7TNH6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nphp3Q7TNH6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Nphp3Q7TNH6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nphp3Q7TNH6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nphp3Q7TNH6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nphp3Q7TNH6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nphp3Q7TNH6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nphp3Q7TNH6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nphp3Q7TNH6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nphp3Q7TNH6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nphp3Q7TNH6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nphp3Q7TNH6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nphp3Q7TNH6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nphp3Q7TNH6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Nphp3Q7TNH6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nphp3Q7TNH6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nphp3Q7TNH6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nphp3Q7TNH6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nphp3Q7TNH6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Nphp3Q7TNH6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Nphp3Q7TNH6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nphp3Q7TNH6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nphp3Q7TNH6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms