Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SugctQ7TNE1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SugctQ7TNE1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SugctQ7TNE1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SugctQ7TNE1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SugctQ7TNE1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SugctQ7TNE1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SugctQ7TNE1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SugctQ7TNE1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SugctQ7TNE1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SugctQ7TNE1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SugctQ7TNE1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SugctQ7TNE1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SugctQ7TNE1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SugctQ7TNE1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SugctQ7TNE1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SugctQ7TNE1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SugctQ7TNE1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SugctQ7TNE1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SugctQ7TNE1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SugctQ7TNE1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SugctQ7TNE1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SugctQ7TNE1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SugctQ7TNE1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SugctQ7TNE1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SugctQ7TNE1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SugctQ7TNE1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SugctQ7TNE1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SugctQ7TNE1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SugctQ7TNE1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SugctQ7TNE1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SugctQ7TNE1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SugctQ7TNE1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SugctQ7TNE1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SugctQ7TNE1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SugctQ7TNE1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SugctQ7TNE1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SugctQ7TNE1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SugctQ7TNE1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SugctQ7TNE1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SugctQ7TNE1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SugctQ7TNE1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SugctQ7TNE1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SugctQ7TNE1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SugctQ7TNE1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SugctQ7TNE1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SugctQ7TNE1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SugctQ7TNE1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SugctQ7TNE1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SugctQ7TNE1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SugctQ7TNE1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SugctQ7TNE1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SugctQ7TNE1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SugctQ7TNE1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SugctQ7TNE1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SugctQ7TNE1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SugctQ7TNE1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SugctQ7TNE1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SugctQ7TNE1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SugctQ7TNE1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SugctQ7TNE1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SugctQ7TNE1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SugctQ7TNE1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SugctQ7TNE1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SugctQ7TNE1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SugctQ7TNE1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SugctQ7TNE1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SugctQ7TNE1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SugctQ7TNE1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SugctQ7TNE1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SugctQ7TNE1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SugctQ7TNE1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SugctQ7TNE1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SugctQ7TNE1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SugctQ7TNE1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SugctQ7TNE1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SugctQ7TNE1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SugctQ7TNE1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SugctQ7TNE1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SugctQ7TNE1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SugctQ7TNE1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SugctQ7TNE1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SugctQ7TNE1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SugctQ7TNE1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SugctQ7TNE1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SugctQ7TNE1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SugctQ7TNE1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SugctQ7TNE1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SugctQ7TNE1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SugctQ7TNE1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SugctQ7TNE1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SugctQ7TNE1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SugctQ7TNE1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SugctQ7TNE1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SugctQ7TNE1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SugctQ7TNE1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SugctQ7TNE1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SugctQ7TNE1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SugctQ7TNE1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SugctQ7TNE1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms