Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMF2

Eri1, 3'-5' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri1Q7TMF2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eri1Q7TMF2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eri1Q7TMF2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eri1Q7TMF2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eri1Q7TMF2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eri1Q7TMF2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eri1Q7TMF2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eri1Q7TMF2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eri1Q7TMF2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eri1Q7TMF2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Eri1Q7TMF2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Eri1Q7TMF2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Eri1Q7TMF2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eri1Q7TMF2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eri1Q7TMF2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Eri1Q7TMF2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eri1Q7TMF2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eri1Q7TMF2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eri1Q7TMF2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eri1Q7TMF2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eri1Q7TMF2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eri1Q7TMF2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eri1Q7TMF2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Eri1Q7TMF2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eri1Q7TMF2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eri1Q7TMF2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eri1Q7TMF2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eri1Q7TMF2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eri1Q7TMF2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eri1Q7TMF2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eri1Q7TMF2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Eri1Q7TMF2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eri1Q7TMF2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eri1Q7TMF2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eri1Q7TMF2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eri1Q7TMF2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eri1Q7TMF2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eri1Q7TMF2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eri1Q7TMF2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eri1Q7TMF2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eri1Q7TMF2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eri1Q7TMF2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eri1Q7TMF2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eri1Q7TMF2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri1Q7TMF2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri1Q7TMF2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri1Q7TMF2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eri1Q7TMF2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eri1Q7TMF2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eri1Q7TMF2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Eri1Q7TMF2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eri1Q7TMF2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eri1Q7TMF2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eri1Q7TMF2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eri1Q7TMF2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eri1Q7TMF2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eri1Q7TMF2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eri1Q7TMF2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eri1Q7TMF2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eri1Q7TMF2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eri1Q7TMF2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms