Protein–RNA interactions for Protein: Q78TU8

Fam107a, Family with sequence similarity 107, member A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107aQ78TU8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam107aQ78TU8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam107aQ78TU8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam107aQ78TU8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam107aQ78TU8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam107aQ78TU8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam107aQ78TU8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam107aQ78TU8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam107aQ78TU8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam107aQ78TU8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam107aQ78TU8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam107aQ78TU8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam107aQ78TU8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam107aQ78TU8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam107aQ78TU8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam107aQ78TU8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam107aQ78TU8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam107aQ78TU8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam107aQ78TU8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam107aQ78TU8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam107aQ78TU8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam107aQ78TU8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam107aQ78TU8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam107aQ78TU8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam107aQ78TU8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam107aQ78TU8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam107aQ78TU8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam107aQ78TU8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam107aQ78TU8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam107aQ78TU8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam107aQ78TU8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam107aQ78TU8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam107aQ78TU8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam107aQ78TU8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam107aQ78TU8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam107aQ78TU8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam107aQ78TU8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam107aQ78TU8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam107aQ78TU8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam107aQ78TU8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam107aQ78TU8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam107aQ78TU8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam107aQ78TU8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam107aQ78TU8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam107aQ78TU8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam107aQ78TU8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam107aQ78TU8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam107aQ78TU8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fam107aQ78TU8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam107aQ78TU8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam107aQ78TU8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fam107aQ78TU8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fam107aQ78TU8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fam107aQ78TU8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam107aQ78TU8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam107aQ78TU8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam107aQ78TU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam107aQ78TU8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam107aQ78TU8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam107aQ78TU8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam107aQ78TU8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam107aQ78TU8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam107aQ78TU8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam107aQ78TU8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam107aQ78TU8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam107aQ78TU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam107aQ78TU8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam107aQ78TU8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam107aQ78TU8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam107aQ78TU8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam107aQ78TU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam107aQ78TU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam107aQ78TU8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam107aQ78TU8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam107aQ78TU8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam107aQ78TU8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam107aQ78TU8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam107aQ78TU8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam107aQ78TU8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam107aQ78TU8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam107aQ78TU8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam107aQ78TU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam107aQ78TU8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam107aQ78TU8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms