Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Stambpl1Q76N33 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Stambpl1Q76N33 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Stambpl1Q76N33 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Stambpl1Q76N33 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Stambpl1Q76N33 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Stambpl1Q76N33 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Stambpl1Q76N33 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Stambpl1Q76N33 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Stambpl1Q76N33 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Stambpl1Q76N33 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,84
Stambpl1Q76N33 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Stambpl1Q76N33 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,55■■□□□ 1,84
Stambpl1Q76N33 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Stambpl1Q76N33 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Stambpl1Q76N33 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Stambpl1Q76N33 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Stambpl1Q76N33 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Stambpl1Q76N33 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Stambpl1Q76N33 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Stambpl1Q76N33 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Stambpl1Q76N33 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Stambpl1Q76N33 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Stambpl1Q76N33 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Stambpl1Q76N33 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Stambpl1Q76N33 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Stambpl1Q76N33 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Stambpl1Q76N33 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Stambpl1Q76N33 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Stambpl1Q76N33 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Stambpl1Q76N33 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Stambpl1Q76N33 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Stambpl1Q76N33 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Stambpl1Q76N33 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Stambpl1Q76N33 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,8
Stambpl1Q76N33 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Stambpl1Q76N33 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Stambpl1Q76N33 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Stambpl1Q76N33 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Stambpl1Q76N33 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Stambpl1Q76N33 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Stambpl1Q76N33 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Stambpl1Q76N33 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Stambpl1Q76N33 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Stambpl1Q76N33 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Stambpl1Q76N33 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Stambpl1Q76N33 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Stambpl1Q76N33 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Stambpl1Q76N33 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Stambpl1Q76N33 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Stambpl1Q76N33 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Stambpl1Q76N33 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Stambpl1Q76N33 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Stambpl1Q76N33 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,1■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Stambpl1Q76N33 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Stambpl1Q76N33 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Stambpl1Q76N33 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Stambpl1Q76N33 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Stambpl1Q76N33 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Stambpl1Q76N33 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Stambpl1Q76N33 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Stambpl1Q76N33 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Stambpl1Q76N33 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Stambpl1Q76N33 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Stambpl1Q76N33 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Stambpl1Q76N33 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Stambpl1Q76N33 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Stambpl1Q76N33 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Stambpl1Q76N33 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Stambpl1Q76N33 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Stambpl1Q76N33 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Stambpl1Q76N33 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Stambpl1Q76N33 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Stambpl1Q76N33 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Stambpl1Q76N33 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Stambpl1Q76N33 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Stambpl1Q76N33 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Stambpl1Q76N33 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Stambpl1Q76N33 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Stambpl1Q76N33 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Stambpl1Q76N33 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Stambpl1Q76N33 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Stambpl1Q76N33 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Stambpl1Q76N33 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Stambpl1Q76N33 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Stambpl1Q76N33 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Stambpl1Q76N33 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53,1 ms