Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ9

Myl12a, MCG5400, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl12aQ6ZWQ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myl12aQ6ZWQ9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myl12aQ6ZWQ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myl12aQ6ZWQ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myl12aQ6ZWQ9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myl12aQ6ZWQ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myl12aQ6ZWQ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myl12aQ6ZWQ9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myl12aQ6ZWQ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myl12aQ6ZWQ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myl12aQ6ZWQ9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Myl12aQ6ZWQ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myl12aQ6ZWQ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myl12aQ6ZWQ9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myl12aQ6ZWQ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myl12aQ6ZWQ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myl12aQ6ZWQ9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myl12aQ6ZWQ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Myl12aQ6ZWQ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myl12aQ6ZWQ9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myl12aQ6ZWQ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myl12aQ6ZWQ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myl12aQ6ZWQ9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myl12aQ6ZWQ9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myl12aQ6ZWQ9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myl12aQ6ZWQ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myl12aQ6ZWQ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myl12aQ6ZWQ9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myl12aQ6ZWQ9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myl12aQ6ZWQ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myl12aQ6ZWQ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Myl12aQ6ZWQ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myl12aQ6ZWQ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myl12aQ6ZWQ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myl12aQ6ZWQ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myl12aQ6ZWQ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myl12aQ6ZWQ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myl12aQ6ZWQ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myl12aQ6ZWQ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myl12aQ6ZWQ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myl12aQ6ZWQ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myl12aQ6ZWQ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myl12aQ6ZWQ9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myl12aQ6ZWQ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Myl12aQ6ZWQ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Myl12aQ6ZWQ9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myl12aQ6ZWQ9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myl12aQ6ZWQ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Myl12aQ6ZWQ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Myl12aQ6ZWQ9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myl12aQ6ZWQ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Myl12aQ6ZWQ9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Myl12aQ6ZWQ9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myl12aQ6ZWQ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myl12aQ6ZWQ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Myl12aQ6ZWQ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Myl12aQ6ZWQ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Myl12aQ6ZWQ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Myl12aQ6ZWQ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Myl12aQ6ZWQ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myl12aQ6ZWQ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myl12aQ6ZWQ9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myl12aQ6ZWQ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Myl12aQ6ZWQ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myl12aQ6ZWQ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Myl12aQ6ZWQ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Myl12aQ6ZWQ9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Myl12aQ6ZWQ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myl12aQ6ZWQ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myl12aQ6ZWQ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Myl12aQ6ZWQ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Myl12aQ6ZWQ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Myl12aQ6ZWQ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Myl12aQ6ZWQ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Myl12aQ6ZWQ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms