Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Kcnt1Q6ZPR4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Kcnt1Q6ZPR4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Kcnt1Q6ZPR4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Kcnt1Q6ZPR4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Kcnt1Q6ZPR4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Kcnt1Q6ZPR4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Kcnt1Q6ZPR4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Kcnt1Q6ZPR4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,08
Kcnt1Q6ZPR4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Kcnt1Q6ZPR4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Kcnt1Q6ZPR4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
Kcnt1Q6ZPR4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Kcnt1Q6ZPR4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Kcnt1Q6ZPR4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Kcnt1Q6ZPR4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Kcnt1Q6ZPR4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Kcnt1Q6ZPR4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Kcnt1Q6ZPR4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Kcnt1Q6ZPR4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Kcnt1Q6ZPR4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Kcnt1Q6ZPR4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Kcnt1Q6ZPR4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Kcnt1Q6ZPR4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Kcnt1Q6ZPR4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Kcnt1Q6ZPR4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Kcnt1Q6ZPR4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Kcnt1Q6ZPR4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Kcnt1Q6ZPR4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Kcnt1Q6ZPR4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Kcnt1Q6ZPR4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Kcnt1Q6ZPR4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Kcnt1Q6ZPR4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Kcnt1Q6ZPR4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Kcnt1Q6ZPR4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Kcnt1Q6ZPR4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Kcnt1Q6ZPR4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Kcnt1Q6ZPR4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Kcnt1Q6ZPR4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Kcnt1Q6ZPR4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Kcnt1Q6ZPR4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Kcnt1Q6ZPR4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Kcnt1Q6ZPR4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Kcnt1Q6ZPR4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Kcnt1Q6ZPR4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Kcnt1Q6ZPR4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Kcnt1Q6ZPR4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Kcnt1Q6ZPR4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Kcnt1Q6ZPR4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Kcnt1Q6ZPR4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Kcnt1Q6ZPR4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Kcnt1Q6ZPR4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Kcnt1Q6ZPR4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Kcnt1Q6ZPR4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Kcnt1Q6ZPR4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Kcnt1Q6ZPR4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Kcnt1Q6ZPR4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Kcnt1Q6ZPR4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Kcnt1Q6ZPR4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,54■■■□□ 2
Kcnt1Q6ZPR4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Kcnt1Q6ZPR4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Kcnt1Q6ZPR4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Kcnt1Q6ZPR4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Kcnt1Q6ZPR4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Kcnt1Q6ZPR4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Kcnt1Q6ZPR4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Kcnt1Q6ZPR4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Kcnt1Q6ZPR4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Kcnt1Q6ZPR4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Kcnt1Q6ZPR4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Kcnt1Q6ZPR4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Kcnt1Q6ZPR4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Kcnt1Q6ZPR4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Kcnt1Q6ZPR4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Kcnt1Q6ZPR4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Kcnt1Q6ZPR4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Kcnt1Q6ZPR4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Kcnt1Q6ZPR4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Kcnt1Q6ZPR4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Kcnt1Q6ZPR4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Kcnt1Q6ZPR4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Kcnt1Q6ZPR4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Kcnt1Q6ZPR4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Kcnt1Q6ZPR4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Kcnt1Q6ZPR4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Kcnt1Q6ZPR4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Kcnt1Q6ZPR4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Kcnt1Q6ZPR4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Kcnt1Q6ZPR4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,9 ms