Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-M2Q6W9L1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-M2Q6W9L1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-M2Q6W9L1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-M2Q6W9L1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-M2Q6W9L1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2-M2Q6W9L1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-M2Q6W9L1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-M2Q6W9L1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-M2Q6W9L1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-M2Q6W9L1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-M2Q6W9L1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-M2Q6W9L1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H2-M2Q6W9L1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-M2Q6W9L1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-M2Q6W9L1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-M2Q6W9L1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-M2Q6W9L1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-M2Q6W9L1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-M2Q6W9L1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-M2Q6W9L1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-M2Q6W9L1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-M2Q6W9L1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-M2Q6W9L1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M2Q6W9L1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M2Q6W9L1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2-M2Q6W9L1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-M2Q6W9L1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-M2Q6W9L1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-M2Q6W9L1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-M2Q6W9L1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
H2-M2Q6W9L1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-M2Q6W9L1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-M2Q6W9L1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-M2Q6W9L1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2-M2Q6W9L1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-M2Q6W9L1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2-M2Q6W9L1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-M2Q6W9L1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2-M2Q6W9L1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-M2Q6W9L1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-M2Q6W9L1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-M2Q6W9L1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-M2Q6W9L1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-M2Q6W9L1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2-M2Q6W9L1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-M2Q6W9L1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M2Q6W9L1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M2Q6W9L1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M2Q6W9L1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M2Q6W9L1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-M2Q6W9L1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-M2Q6W9L1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-M2Q6W9L1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-M2Q6W9L1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-M2Q6W9L1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-M2Q6W9L1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-M2Q6W9L1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M2Q6W9L1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-M2Q6W9L1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-M2Q6W9L1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-M2Q6W9L1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-M2Q6W9L1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-M2Q6W9L1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-M2Q6W9L1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M2Q6W9L1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-M2Q6W9L1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-M2Q6W9L1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M2Q6W9L1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-M2Q6W9L1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-M2Q6W9L1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-M2Q6W9L1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-M2Q6W9L1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-M2Q6W9L1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-M2Q6W9L1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-M2Q6W9L1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M2Q6W9L1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-M2Q6W9L1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M2Q6W9L1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M2Q6W9L1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-M2Q6W9L1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-M2Q6W9L1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-M2Q6W9L1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-M2Q6W9L1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms