Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmd5Q6P5H6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmd5Q6P5H6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmd5Q6P5H6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmd5Q6P5H6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmd5Q6P5H6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Frmd5Q6P5H6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmd5Q6P5H6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmd5Q6P5H6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Frmd5Q6P5H6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Frmd5Q6P5H6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Frmd5Q6P5H6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Frmd5Q6P5H6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmd5Q6P5H6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmd5Q6P5H6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmd5Q6P5H6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmd5Q6P5H6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmd5Q6P5H6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmd5Q6P5H6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmd5Q6P5H6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmd5Q6P5H6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Frmd5Q6P5H6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmd5Q6P5H6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmd5Q6P5H6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Frmd5Q6P5H6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frmd5Q6P5H6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmd5Q6P5H6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmd5Q6P5H6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmd5Q6P5H6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmd5Q6P5H6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmd5Q6P5H6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmd5Q6P5H6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmd5Q6P5H6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmd5Q6P5H6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmd5Q6P5H6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmd5Q6P5H6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmd5Q6P5H6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmd5Q6P5H6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmd5Q6P5H6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frmd5Q6P5H6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frmd5Q6P5H6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Frmd5Q6P5H6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmd5Q6P5H6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frmd5Q6P5H6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmd5Q6P5H6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmd5Q6P5H6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Frmd5Q6P5H6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmd5Q6P5H6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmd5Q6P5H6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmd5Q6P5H6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmd5Q6P5H6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmd5Q6P5H6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmd5Q6P5H6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmd5Q6P5H6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frmd5Q6P5H6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmd5Q6P5H6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmd5Q6P5H6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmd5Q6P5H6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmd5Q6P5H6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmd5Q6P5H6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmd5Q6P5H6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmd5Q6P5H6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Frmd5Q6P5H6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmd5Q6P5H6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmd5Q6P5H6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmd5Q6P5H6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmd5Q6P5H6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmd5Q6P5H6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmd5Q6P5H6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmd5Q6P5H6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmd5Q6P5H6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmd5Q6P5H6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmd5Q6P5H6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmd5Q6P5H6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmd5Q6P5H6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmd5Q6P5H6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmd5Q6P5H6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmd5Q6P5H6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmd5Q6P5H6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmd5Q6P5H6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmd5Q6P5H6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmd5Q6P5H6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmd5Q6P5H6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmd5Q6P5H6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmd5Q6P5H6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmd5Q6P5H6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmd5Q6P5H6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmd5Q6P5H6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmd5Q6P5H6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmd5Q6P5H6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmd5Q6P5H6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmd5Q6P5H6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmd5Q6P5H6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmd5Q6P5H6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmd5Q6P5H6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmd5Q6P5H6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmd5Q6P5H6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmd5Q6P5H6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmd5Q6P5H6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmd5Q6P5H6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms