Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nlrp4fQ66X05 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nlrp4fQ66X05 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nlrp4fQ66X05 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlrp4fQ66X05 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nlrp4fQ66X05 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nlrp4fQ66X05 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlrp4fQ66X05 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlrp4fQ66X05 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlrp4fQ66X05 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nlrp4fQ66X05 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp4fQ66X05 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp4fQ66X05 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp4fQ66X05 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp4fQ66X05 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nlrp4fQ66X05 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nlrp4fQ66X05 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlrp4fQ66X05 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlrp4fQ66X05 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp4fQ66X05 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp4fQ66X05 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp4fQ66X05 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp4fQ66X05 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp4fQ66X05 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp4fQ66X05 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlrp4fQ66X05 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlrp4fQ66X05 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrp4fQ66X05 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms