Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nlrp4fQ66X05 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nlrp4fQ66X05 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nlrp4fQ66X05 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlrp4fQ66X05 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nlrp4fQ66X05 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nlrp4fQ66X05 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlrp4fQ66X05 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlrp4fQ66X05 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nlrp4fQ66X05 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nlrp4fQ66X05 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nlrp4fQ66X05 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp4fQ66X05 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlrp4fQ66X05 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlrp4fQ66X05 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp4fQ66X05 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlrp4fQ66X05 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp4fQ66X05 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlrp4fQ66X05 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nlrp4fQ66X05 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlrp4fQ66X05 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nlrp4fQ66X05 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlrp4fQ66X05 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlrp4fQ66X05 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp4fQ66X05 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp4fQ66X05 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp4fQ66X05 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp4fQ66X05 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp4fQ66X05 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp4fQ66X05 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp4fQ66X05 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp4fQ66X05 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrp4fQ66X05 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlrp4fQ66X05 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlrp4fQ66X05 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrp4fQ66X05 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms