Protein–RNA interactions for Protein: Q64523

Hist2h2ac, Histone H2A type 2-C, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2acQ64523 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hist2h2acQ64523 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hist2h2acQ64523 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hist2h2acQ64523 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hist2h2acQ64523 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hist2h2acQ64523 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hist2h2acQ64523 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hist2h2acQ64523 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hist2h2acQ64523 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hist2h2acQ64523 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hist2h2acQ64523 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hist2h2acQ64523 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hist2h2acQ64523 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hist2h2acQ64523 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hist2h2acQ64523 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hist2h2acQ64523 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hist2h2acQ64523 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hist2h2acQ64523 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hist2h2acQ64523 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hist2h2acQ64523 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hist2h2acQ64523 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hist2h2acQ64523 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hist2h2acQ64523 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hist2h2acQ64523 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hist2h2acQ64523 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hist2h2acQ64523 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hist2h2acQ64523 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hist2h2acQ64523 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hist2h2acQ64523 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hist2h2acQ64523 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hist2h2acQ64523 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hist2h2acQ64523 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hist2h2acQ64523 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hist2h2acQ64523 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hist2h2acQ64523 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hist2h2acQ64523 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hist2h2acQ64523 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hist2h2acQ64523 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hist2h2acQ64523 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hist2h2acQ64523 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hist2h2acQ64523 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hist2h2acQ64523 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hist2h2acQ64523 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hist2h2acQ64523 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hist2h2acQ64523 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hist2h2acQ64523 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hist2h2acQ64523 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hist2h2acQ64523 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hist2h2acQ64523 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hist2h2acQ64523 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hist2h2acQ64523 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hist2h2acQ64523 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hist2h2acQ64523 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hist2h2acQ64523 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hist2h2acQ64523 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hist2h2acQ64523 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hist2h2acQ64523 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hist2h2acQ64523 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hist2h2acQ64523 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hist2h2acQ64523 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hist2h2acQ64523 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hist2h2acQ64523 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hist2h2acQ64523 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hist2h2acQ64523 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hist2h2acQ64523 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hist2h2acQ64523 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hist2h2acQ64523 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hist2h2acQ64523 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hist2h2acQ64523 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hist2h2acQ64523 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hist2h2acQ64523 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hist2h2acQ64523 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hist2h2acQ64523 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hist2h2acQ64523 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hist2h2acQ64523 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hist2h2acQ64523 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hist2h2acQ64523 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms