Protein–RNA interactions for Protein: Q64345

Ifit3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3Q64345 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifit3Q64345 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifit3Q64345 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifit3Q64345 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Ifit3Q64345 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ifit3Q64345 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ifit3Q64345 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifit3Q64345 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifit3Q64345 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifit3Q64345 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifit3Q64345 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ifit3Q64345 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifit3Q64345 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifit3Q64345 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifit3Q64345 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifit3Q64345 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifit3Q64345 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifit3Q64345 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifit3Q64345 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifit3Q64345 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifit3Q64345 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifit3Q64345 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ifit3Q64345 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ifit3Q64345 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ifit3Q64345 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ifit3Q64345 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifit3Q64345 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifit3Q64345 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifit3Q64345 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ifit3Q64345 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifit3Q64345 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ifit3Q64345 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ifit3Q64345 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifit3Q64345 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifit3Q64345 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifit3Q64345 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifit3Q64345 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifit3Q64345 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifit3Q64345 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ifit3Q64345 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifit3Q64345 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifit3Q64345 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifit3Q64345 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifit3Q64345 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifit3Q64345 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifit3Q64345 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifit3Q64345 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifit3Q64345 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ifit3Q64345 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ifit3Q64345 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ifit3Q64345 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifit3Q64345 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifit3Q64345 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifit3Q64345 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifit3Q64345 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifit3Q64345 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifit3Q64345 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifit3Q64345 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifit3Q64345 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifit3Q64345 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifit3Q64345 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifit3Q64345 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifit3Q64345 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifit3Q64345 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifit3Q64345 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifit3Q64345 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifit3Q64345 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifit3Q64345 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifit3Q64345 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifit3Q64345 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifit3Q64345 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifit3Q64345 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifit3Q64345 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifit3Q64345 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifit3Q64345 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifit3Q64345 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifit3Q64345 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifit3Q64345 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifit3Q64345 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifit3Q64345 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifit3Q64345 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifit3Q64345 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifit3Q64345 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifit3Q64345 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifit3Q64345 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifit3Q64345 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifit3Q64345 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifit3Q64345 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifit3Q64345 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifit3Q64345 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifit3Q64345 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifit3Q64345 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifit3Q64345 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms