Protein–RNA interactions for Protein: Q64329

Klra3, Killer cell lectin-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra3Q64329 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Klra3Q64329 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Klra3Q64329 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Klra3Q64329 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Klra3Q64329 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Klra3Q64329 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Klra3Q64329 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Klra3Q64329 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Klra3Q64329 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Klra3Q64329 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Klra3Q64329 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Klra3Q64329 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Klra3Q64329 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Klra3Q64329 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Klra3Q64329 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Klra3Q64329 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Klra3Q64329 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Klra3Q64329 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Klra3Q64329 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Klra3Q64329 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Klra3Q64329 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Klra3Q64329 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Klra3Q64329 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Klra3Q64329 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Klra3Q64329 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Klra3Q64329 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Klra3Q64329 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Klra3Q64329 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Klra3Q64329 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Klra3Q64329 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Klra3Q64329 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Klra3Q64329 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Klra3Q64329 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Klra3Q64329 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Klra3Q64329 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Klra3Q64329 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Klra3Q64329 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Klra3Q64329 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Klra3Q64329 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Klra3Q64329 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Klra3Q64329 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Klra3Q64329 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Klra3Q64329 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Klra3Q64329 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Klra3Q64329 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Klra3Q64329 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Klra3Q64329 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Klra3Q64329 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Klra3Q64329 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Klra3Q64329 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Klra3Q64329 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Klra3Q64329 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Klra3Q64329 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Klra3Q64329 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Klra3Q64329 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Klra3Q64329 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Klra3Q64329 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Klra3Q64329 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Klra3Q64329 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Klra3Q64329 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Klra3Q64329 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Klra3Q64329 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Klra3Q64329 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Klra3Q64329 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Klra3Q64329 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Klra3Q64329 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Klra3Q64329 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Klra3Q64329 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,66■■□□□ 1,86
Klra3Q64329 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Klra3Q64329 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Klra3Q64329 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Klra3Q64329 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Klra3Q64329 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Klra3Q64329 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Klra3Q64329 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Klra3Q64329 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Klra3Q64329 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Klra3Q64329 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Klra3Q64329 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Klra3Q64329 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Klra3Q64329 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Klra3Q64329 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Klra3Q64329 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Klra3Q64329 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Klra3Q64329 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Klra3Q64329 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Klra3Q64329 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Klra3Q64329 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Klra3Q64329 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Klra3Q64329 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Klra3Q64329 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Klra3Q64329 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Klra3Q64329 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Klra3Q64329 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Klra3Q64329 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26,46■■□□□ 1,83
Klra3Q64329 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Klra3Q64329 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Klra3Q64329 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Klra3Q64329 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Klra3Q64329 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,5 ms