Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zic2Q62520 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zic2Q62520 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zic2Q62520 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zic2Q62520 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zic2Q62520 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zic2Q62520 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zic2Q62520 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zic2Q62520 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zic2Q62520 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zic2Q62520 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zic2Q62520 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zic2Q62520 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zic2Q62520 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zic2Q62520 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zic2Q62520 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zic2Q62520 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zic2Q62520 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zic2Q62520 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zic2Q62520 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zic2Q62520 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Zic2Q62520 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zic2Q62520 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zic2Q62520 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zic2Q62520 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zic2Q62520 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zic2Q62520 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zic2Q62520 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zic2Q62520 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zic2Q62520 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zic2Q62520 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zic2Q62520 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zic2Q62520 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zic2Q62520 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zic2Q62520 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zic2Q62520 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zic2Q62520 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zic2Q62520 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zic2Q62520 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zic2Q62520 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zic2Q62520 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zic2Q62520 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zic2Q62520 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zic2Q62520 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zic2Q62520 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zic2Q62520 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zic2Q62520 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zic2Q62520 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zic2Q62520 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zic2Q62520 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zic2Q62520 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Zic2Q62520 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zic2Q62520 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zic2Q62520 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zic2Q62520 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zic2Q62520 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zic2Q62520 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zic2Q62520 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zic2Q62520 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zic2Q62520 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Zic2Q62520 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zic2Q62520 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zic2Q62520 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zic2Q62520 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zic2Q62520 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zic2Q62520 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zic2Q62520 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zic2Q62520 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zic2Q62520 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zic2Q62520 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zic2Q62520 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zic2Q62520 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zic2Q62520 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zic2Q62520 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zic2Q62520 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zic2Q62520 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Zic2Q62520 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zic2Q62520 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zic2Q62520 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zic2Q62520 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zic2Q62520 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zic2Q62520 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zic2Q62520 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zic2Q62520 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zic2Q62520 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zic2Q62520 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zic2Q62520 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Zic2Q62520 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zic2Q62520 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zic2Q62520 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zic2Q62520 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zic2Q62520 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zic2Q62520 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zic2Q62520 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zic2Q62520 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zic2Q62520 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zic2Q62520 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zic2Q62520 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zic2Q62520 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zic2Q62520 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms