Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prkd1Q62101 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prkd1Q62101 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkd1Q62101 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prkd1Q62101 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prkd1Q62101 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prkd1Q62101 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkd1Q62101 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prkd1Q62101 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prkd1Q62101 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkd1Q62101 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prkd1Q62101 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prkd1Q62101 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prkd1Q62101 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prkd1Q62101 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prkd1Q62101 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prkd1Q62101 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prkd1Q62101 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prkd1Q62101 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prkd1Q62101 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkd1Q62101 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkd1Q62101 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkd1Q62101 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkd1Q62101 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkd1Q62101 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkd1Q62101 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkd1Q62101 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkd1Q62101 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkd1Q62101 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkd1Q62101 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkd1Q62101 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkd1Q62101 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkd1Q62101 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkd1Q62101 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkd1Q62101 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkd1Q62101 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkd1Q62101 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkd1Q62101 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkd1Q62101 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkd1Q62101 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkd1Q62101 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkd1Q62101 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkd1Q62101 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkd1Q62101 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkd1Q62101 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkd1Q62101 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkd1Q62101 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkd1Q62101 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkd1Q62101 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkd1Q62101 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkd1Q62101 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkd1Q62101 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkd1Q62101 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkd1Q62101 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prkd1Q62101 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Prkd1Q62101 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkd1Q62101 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkd1Q62101 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkd1Q62101 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkd1Q62101 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkd1Q62101 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkd1Q62101 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkd1Q62101 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkd1Q62101 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkd1Q62101 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkd1Q62101 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkd1Q62101 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkd1Q62101 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkd1Q62101 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkd1Q62101 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkd1Q62101 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkd1Q62101 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkd1Q62101 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkd1Q62101 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkd1Q62101 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkd1Q62101 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prkd1Q62101 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkd1Q62101 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkd1Q62101 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkd1Q62101 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkd1Q62101 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkd1Q62101 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkd1Q62101 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkd1Q62101 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkd1Q62101 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prkd1Q62101 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkd1Q62101 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkd1Q62101 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkd1Q62101 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkd1Q62101 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkd1Q62101 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkd1Q62101 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkd1Q62101 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkd1Q62101 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkd1Q62101 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkd1Q62101 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkd1Q62101 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkd1Q62101 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkd1Q62101 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkd1Q62101 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.5 ms