Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Prkd1Q62101 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Prkd1Q62101 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Prkd1Q62101 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Prkd1Q62101 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Prkd1Q62101 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Prkd1Q62101 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Prkd1Q62101 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Prkd1Q62101 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Prkd1Q62101 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Prkd1Q62101 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Prkd1Q62101 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Prkd1Q62101 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Prkd1Q62101 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Prkd1Q62101 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Prkd1Q62101 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Prkd1Q62101 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Prkd1Q62101 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
Prkd1Q62101 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,89■■□□□ 1,58
Prkd1Q62101 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Prkd1Q62101 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Prkd1Q62101 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Prkd1Q62101 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Prkd1Q62101 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Prkd1Q62101 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Prkd1Q62101 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Prkd1Q62101 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Prkd1Q62101 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Prkd1Q62101 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Prkd1Q62101 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Prkd1Q62101 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Prkd1Q62101 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Prkd1Q62101 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Prkd1Q62101 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Prkd1Q62101 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Prkd1Q62101 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Prkd1Q62101 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Prkd1Q62101 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Prkd1Q62101 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Prkd1Q62101 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Prkd1Q62101 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Prkd1Q62101 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Prkd1Q62101 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
Prkd1Q62101 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Prkd1Q62101 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Prkd1Q62101 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Prkd1Q62101 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Prkd1Q62101 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Prkd1Q62101 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Prkd1Q62101 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Prkd1Q62101 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Prkd1Q62101 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Prkd1Q62101 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Prkd1Q62101 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,53
Prkd1Q62101 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,64■■□□□ 1,53
Prkd1Q62101 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Prkd1Q62101 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Prkd1Q62101 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Prkd1Q62101 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Prkd1Q62101 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Prkd1Q62101 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Prkd1Q62101 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Prkd1Q62101 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24,58■■□□□ 1,53
Prkd1Q62101 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Prkd1Q62101 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Prkd1Q62101 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Prkd1Q62101 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Prkd1Q62101 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Prkd1Q62101 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Prkd1Q62101 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Prkd1Q62101 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Prkd1Q62101 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Prkd1Q62101 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Prkd1Q62101 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Prkd1Q62101 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Prkd1Q62101 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Prkd1Q62101 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Prkd1Q62101 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Prkd1Q62101 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Prkd1Q62101 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Prkd1Q62101 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
Prkd1Q62101 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Prkd1Q62101 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Prkd1Q62101 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Prkd1Q62101 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Prkd1Q62101 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Prkd1Q62101 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Prkd1Q62101 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Prkd1Q62101 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Prkd1Q62101 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Prkd1Q62101 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Prkd1Q62101 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Prkd1Q62101 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Prkd1Q62101 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Prkd1Q62101 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Prkd1Q62101 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,32■■□□□ 1,48
Prkd1Q62101 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Prkd1Q62101 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24,3■■□□□ 1,48
Prkd1Q62101 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24,3■■□□□ 1,48
Prkd1Q62101 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,1 ms