Protein–RNA interactions for Protein: Q61645

Hr, Lysine-specific demethylase hairless, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrQ61645 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
HrQ61645 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HrQ61645 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HrQ61645 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HrQ61645 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HrQ61645 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HrQ61645 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HrQ61645 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HrQ61645 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HrQ61645 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HrQ61645 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HrQ61645 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HrQ61645 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HrQ61645 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HrQ61645 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HrQ61645 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HrQ61645 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HrQ61645 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HrQ61645 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HrQ61645 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HrQ61645 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HrQ61645 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HrQ61645 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HrQ61645 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HrQ61645 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HrQ61645 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HrQ61645 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HrQ61645 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HrQ61645 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HrQ61645 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HrQ61645 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HrQ61645 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HrQ61645 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HrQ61645 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HrQ61645 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HrQ61645 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HrQ61645 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrQ61645 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HrQ61645 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HrQ61645 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HrQ61645 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HrQ61645 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrQ61645 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HrQ61645 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HrQ61645 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HrQ61645 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HrQ61645 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HrQ61645 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HrQ61645 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HrQ61645 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HrQ61645 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HrQ61645 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HrQ61645 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HrQ61645 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HrQ61645 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HrQ61645 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HrQ61645 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HrQ61645 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HrQ61645 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HrQ61645 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HrQ61645 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HrQ61645 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HrQ61645 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
HrQ61645 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HrQ61645 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HrQ61645 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HrQ61645 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HrQ61645 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HrQ61645 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HrQ61645 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HrQ61645 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HrQ61645 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HrQ61645 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HrQ61645 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HrQ61645 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HrQ61645 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HrQ61645 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HrQ61645 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HrQ61645 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HrQ61645 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HrQ61645 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HrQ61645 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HrQ61645 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HrQ61645 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HrQ61645 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HrQ61645 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrQ61645 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrQ61645 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrQ61645 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrQ61645 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HrQ61645 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HrQ61645 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrQ61645 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrQ61645 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrQ61645 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HrQ61645 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HrQ61645 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HrQ61645 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HrQ61645 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HrQ61645 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms