Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pacsin1Q61644 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pacsin1Q61644 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pacsin1Q61644 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pacsin1Q61644 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pacsin1Q61644 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pacsin1Q61644 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pacsin1Q61644 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pacsin1Q61644 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pacsin1Q61644 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pacsin1Q61644 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pacsin1Q61644 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pacsin1Q61644 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pacsin1Q61644 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pacsin1Q61644 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pacsin1Q61644 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pacsin1Q61644 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Pacsin1Q61644 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pacsin1Q61644 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pacsin1Q61644 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pacsin1Q61644 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pacsin1Q61644 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pacsin1Q61644 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pacsin1Q61644 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pacsin1Q61644 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pacsin1Q61644 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pacsin1Q61644 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pacsin1Q61644 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pacsin1Q61644 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pacsin1Q61644 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pacsin1Q61644 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pacsin1Q61644 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pacsin1Q61644 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pacsin1Q61644 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pacsin1Q61644 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pacsin1Q61644 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pacsin1Q61644 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pacsin1Q61644 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pacsin1Q61644 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pacsin1Q61644 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pacsin1Q61644 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pacsin1Q61644 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pacsin1Q61644 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pacsin1Q61644 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pacsin1Q61644 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pacsin1Q61644 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pacsin1Q61644 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pacsin1Q61644 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pacsin1Q61644 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pacsin1Q61644 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pacsin1Q61644 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pacsin1Q61644 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pacsin1Q61644 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pacsin1Q61644 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pacsin1Q61644 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pacsin1Q61644 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Pacsin1Q61644 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pacsin1Q61644 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pacsin1Q61644 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pacsin1Q61644 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pacsin1Q61644 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pacsin1Q61644 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pacsin1Q61644 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pacsin1Q61644 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pacsin1Q61644 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pacsin1Q61644 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pacsin1Q61644 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pacsin1Q61644 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pacsin1Q61644 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pacsin1Q61644 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pacsin1Q61644 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pacsin1Q61644 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Pacsin1Q61644 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pacsin1Q61644 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Pacsin1Q61644 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pacsin1Q61644 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pacsin1Q61644 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pacsin1Q61644 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pacsin1Q61644 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pacsin1Q61644 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pacsin1Q61644 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pacsin1Q61644 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pacsin1Q61644 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pacsin1Q61644 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pacsin1Q61644 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pacsin1Q61644 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pacsin1Q61644 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pacsin1Q61644 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pacsin1Q61644 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pacsin1Q61644 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pacsin1Q61644 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pacsin1Q61644 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pacsin1Q61644 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pacsin1Q61644 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pacsin1Q61644 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pacsin1Q61644 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pacsin1Q61644 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pacsin1Q61644 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pacsin1Q61644 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pacsin1Q61644 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms