Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ifi47Q61635 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ifi47Q61635 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ifi47Q61635 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ifi47Q61635 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ifi47Q61635 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ifi47Q61635 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ifi47Q61635 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ifi47Q61635 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ifi47Q61635 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ifi47Q61635 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ifi47Q61635 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ifi47Q61635 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ifi47Q61635 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ifi47Q61635 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ifi47Q61635 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ifi47Q61635 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ifi47Q61635 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ifi47Q61635 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ifi47Q61635 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ifi47Q61635 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ifi47Q61635 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ifi47Q61635 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ifi47Q61635 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ifi47Q61635 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ifi47Q61635 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ifi47Q61635 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ifi47Q61635 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ifi47Q61635 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifi47Q61635 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifi47Q61635 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ifi47Q61635 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ifi47Q61635 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifi47Q61635 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifi47Q61635 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifi47Q61635 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ifi47Q61635 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ifi47Q61635 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ifi47Q61635 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ifi47Q61635 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ifi47Q61635 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ifi47Q61635 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ifi47Q61635 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ifi47Q61635 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifi47Q61635 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ifi47Q61635 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ifi47Q61635 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ifi47Q61635 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ifi47Q61635 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifi47Q61635 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifi47Q61635 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifi47Q61635 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ifi47Q61635 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifi47Q61635 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifi47Q61635 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifi47Q61635 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifi47Q61635 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifi47Q61635 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifi47Q61635 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ifi47Q61635 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifi47Q61635 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifi47Q61635 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifi47Q61635 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ifi47Q61635 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifi47Q61635 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifi47Q61635 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifi47Q61635 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifi47Q61635 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ifi47Q61635 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ifi47Q61635 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifi47Q61635 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifi47Q61635 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ifi47Q61635 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ifi47Q61635 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ifi47Q61635 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ifi47Q61635 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ifi47Q61635 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ifi47Q61635 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ifi47Q61635 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ifi47Q61635 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifi47Q61635 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ifi47Q61635 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ifi47Q61635 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ifi47Q61635 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ifi47Q61635 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ifi47Q61635 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ifi47Q61635 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ifi47Q61635 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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