Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd53Q61451 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd53Q61451 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd53Q61451 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd53Q61451 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd53Q61451 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cd53Q61451 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd53Q61451 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd53Q61451 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd53Q61451 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd53Q61451 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd53Q61451 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd53Q61451 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd53Q61451 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd53Q61451 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd53Q61451 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd53Q61451 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd53Q61451 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd53Q61451 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd53Q61451 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd53Q61451 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd53Q61451 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd53Q61451 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cd53Q61451 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd53Q61451 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd53Q61451 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd53Q61451 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd53Q61451 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd53Q61451 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd53Q61451 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd53Q61451 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd53Q61451 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd53Q61451 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd53Q61451 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd53Q61451 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd53Q61451 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd53Q61451 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd53Q61451 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd53Q61451 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd53Q61451 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd53Q61451 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd53Q61451 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd53Q61451 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd53Q61451 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd53Q61451 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd53Q61451 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd53Q61451 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd53Q61451 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd53Q61451 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd53Q61451 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd53Q61451 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd53Q61451 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd53Q61451 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd53Q61451 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd53Q61451 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd53Q61451 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd53Q61451 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd53Q61451 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd53Q61451 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd53Q61451 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd53Q61451 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd53Q61451 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd53Q61451 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd53Q61451 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd53Q61451 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd53Q61451 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd53Q61451 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd53Q61451 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd53Q61451 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd53Q61451 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd53Q61451 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd53Q61451 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd53Q61451 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd53Q61451 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd53Q61451 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms