Protein–RNA interactions for Protein: Q61410

Prkg2, cGMP-dependent protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkg2Q61410 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkg2Q61410 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkg2Q61410 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prkg2Q61410 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkg2Q61410 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkg2Q61410 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkg2Q61410 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkg2Q61410 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkg2Q61410 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkg2Q61410 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkg2Q61410 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkg2Q61410 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkg2Q61410 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkg2Q61410 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkg2Q61410 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkg2Q61410 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkg2Q61410 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkg2Q61410 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkg2Q61410 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkg2Q61410 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkg2Q61410 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkg2Q61410 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkg2Q61410 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkg2Q61410 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prkg2Q61410 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prkg2Q61410 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prkg2Q61410 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prkg2Q61410 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkg2Q61410 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkg2Q61410 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prkg2Q61410 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkg2Q61410 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkg2Q61410 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prkg2Q61410 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkg2Q61410 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkg2Q61410 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkg2Q61410 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkg2Q61410 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkg2Q61410 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkg2Q61410 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkg2Q61410 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkg2Q61410 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkg2Q61410 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkg2Q61410 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkg2Q61410 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkg2Q61410 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkg2Q61410 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkg2Q61410 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkg2Q61410 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkg2Q61410 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkg2Q61410 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkg2Q61410 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkg2Q61410 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkg2Q61410 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkg2Q61410 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkg2Q61410 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkg2Q61410 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkg2Q61410 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkg2Q61410 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkg2Q61410 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkg2Q61410 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkg2Q61410 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkg2Q61410 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkg2Q61410 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkg2Q61410 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prkg2Q61410 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkg2Q61410 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkg2Q61410 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkg2Q61410 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkg2Q61410 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prkg2Q61410 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prkg2Q61410 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prkg2Q61410 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkg2Q61410 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prkg2Q61410 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkg2Q61410 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkg2Q61410 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkg2Q61410 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkg2Q61410 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkg2Q61410 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkg2Q61410 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkg2Q61410 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkg2Q61410 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkg2Q61410 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkg2Q61410 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkg2Q61410 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkg2Q61410 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms