Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ctnna2Q61301 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ctnna2Q61301 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ctnna2Q61301 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ctnna2Q61301 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ctnna2Q61301 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ctnna2Q61301 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Ctnna2Q61301 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ctnna2Q61301 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Ctnna2Q61301 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Ctnna2Q61301 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Ctnna2Q61301 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ctnna2Q61301 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ctnna2Q61301 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ctnna2Q61301 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ctnna2Q61301 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ctnna2Q61301 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ctnna2Q61301 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ctnna2Q61301 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ctnna2Q61301 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ctnna2Q61301 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ctnna2Q61301 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ctnna2Q61301 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ctnna2Q61301 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ctnna2Q61301 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Ctnna2Q61301 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Ctnna2Q61301 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ctnna2Q61301 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ctnna2Q61301 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ctnna2Q61301 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ctnna2Q61301 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Ctnna2Q61301 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Ctnna2Q61301 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ctnna2Q61301 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ctnna2Q61301 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Ctnna2Q61301 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ctnna2Q61301 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ctnna2Q61301 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ctnna2Q61301 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ctnna2Q61301 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ctnna2Q61301 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ctnna2Q61301 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ctnna2Q61301 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ctnna2Q61301 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Ctnna2Q61301 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ctnna2Q61301 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ctnna2Q61301 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ctnna2Q61301 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ctnna2Q61301 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Ctnna2Q61301 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,87■■□□□ 1,89
Ctnna2Q61301 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ctnna2Q61301 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ctnna2Q61301 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ctnna2Q61301 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,83■■□□□ 1,88
Ctnna2Q61301 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ctnna2Q61301 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ctnna2Q61301 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ctnna2Q61301 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ctnna2Q61301 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ctnna2Q61301 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ctnna2Q61301 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ctnna2Q61301 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ctnna2Q61301 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ctnna2Q61301 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ctnna2Q61301 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ctnna2Q61301 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ctnna2Q61301 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ctnna2Q61301 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ctnna2Q61301 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ctnna2Q61301 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ctnna2Q61301 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Ctnna2Q61301 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ctnna2Q61301 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ctnna2Q61301 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ctnna2Q61301 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ctnna2Q61301 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,6 ms