Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acvr1bQ61271 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acvr1bQ61271 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1bQ61271 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1bQ61271 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Acvr1bQ61271 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acvr1bQ61271 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acvr1bQ61271 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Acvr1bQ61271 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Acvr1bQ61271 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Acvr1bQ61271 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Acvr1bQ61271 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Acvr1bQ61271 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acvr1bQ61271 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acvr1bQ61271 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Acvr1bQ61271 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Acvr1bQ61271 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Acvr1bQ61271 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Acvr1bQ61271 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Acvr1bQ61271 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Acvr1bQ61271 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Acvr1bQ61271 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Acvr1bQ61271 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Acvr1bQ61271 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acvr1bQ61271 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Acvr1bQ61271 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acvr1bQ61271 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Acvr1bQ61271 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Acvr1bQ61271 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acvr1bQ61271 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Acvr1bQ61271 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acvr1bQ61271 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acvr1bQ61271 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Acvr1bQ61271 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acvr1bQ61271 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acvr1bQ61271 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acvr1bQ61271 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Acvr1bQ61271 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acvr1bQ61271 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acvr1bQ61271 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acvr1bQ61271 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1bQ61271 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acvr1bQ61271 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acvr1bQ61271 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acvr1bQ61271 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Acvr1bQ61271 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acvr1bQ61271 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acvr1bQ61271 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acvr1bQ61271 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Acvr1bQ61271 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Acvr1bQ61271 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acvr1bQ61271 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acvr1bQ61271 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acvr1bQ61271 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Acvr1bQ61271 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Acvr1bQ61271 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Acvr1bQ61271 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Acvr1bQ61271 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Acvr1bQ61271 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Acvr1bQ61271 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Acvr1bQ61271 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Acvr1bQ61271 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Acvr1bQ61271 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acvr1bQ61271 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Acvr1bQ61271 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acvr1bQ61271 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acvr1bQ61271 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acvr1bQ61271 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acvr1bQ61271 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acvr1bQ61271 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acvr1bQ61271 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Acvr1bQ61271 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acvr1bQ61271 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acvr1bQ61271 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Acvr1bQ61271 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acvr1bQ61271 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acvr1bQ61271 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acvr1bQ61271 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acvr1bQ61271 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acvr1bQ61271 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acvr1bQ61271 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Acvr1bQ61271 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acvr1bQ61271 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acvr1bQ61271 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Acvr1bQ61271 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acvr1bQ61271 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acvr1bQ61271 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acvr1bQ61271 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acvr1bQ61271 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acvr1bQ61271 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acvr1bQ61271 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acvr1bQ61271 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acvr1bQ61271 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acvr1bQ61271 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acvr1bQ61271 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acvr1bQ61271 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acvr1bQ61271 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acvr1bQ61271 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acvr1bQ61271 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acvr1bQ61271 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms