Protein–RNA interactions for Protein: Q61235

Sntb2, Beta-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntb2Q61235 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sntb2Q61235 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sntb2Q61235 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sntb2Q61235 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sntb2Q61235 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sntb2Q61235 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sntb2Q61235 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sntb2Q61235 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sntb2Q61235 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sntb2Q61235 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sntb2Q61235 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sntb2Q61235 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sntb2Q61235 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sntb2Q61235 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sntb2Q61235 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sntb2Q61235 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sntb2Q61235 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sntb2Q61235 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sntb2Q61235 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sntb2Q61235 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sntb2Q61235 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sntb2Q61235 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sntb2Q61235 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sntb2Q61235 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sntb2Q61235 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sntb2Q61235 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sntb2Q61235 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sntb2Q61235 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sntb2Q61235 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sntb2Q61235 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sntb2Q61235 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sntb2Q61235 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sntb2Q61235 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sntb2Q61235 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sntb2Q61235 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sntb2Q61235 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sntb2Q61235 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sntb2Q61235 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sntb2Q61235 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sntb2Q61235 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sntb2Q61235 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sntb2Q61235 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sntb2Q61235 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sntb2Q61235 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sntb2Q61235 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sntb2Q61235 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sntb2Q61235 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sntb2Q61235 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sntb2Q61235 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sntb2Q61235 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sntb2Q61235 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sntb2Q61235 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sntb2Q61235 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sntb2Q61235 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sntb2Q61235 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sntb2Q61235 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sntb2Q61235 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sntb2Q61235 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sntb2Q61235 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sntb2Q61235 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sntb2Q61235 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sntb2Q61235 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sntb2Q61235 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sntb2Q61235 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sntb2Q61235 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sntb2Q61235 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sntb2Q61235 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sntb2Q61235 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sntb2Q61235 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sntb2Q61235 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sntb2Q61235 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sntb2Q61235 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sntb2Q61235 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sntb2Q61235 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sntb2Q61235 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sntb2Q61235 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms