Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc1Q61056 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc1Q61056 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc1Q61056 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc1Q61056 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc1Q61056 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc1Q61056 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc1Q61056 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc1Q61056 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc1Q61056 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc1Q61056 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc1Q61056 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc1Q61056 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc1Q61056 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trpc1Q61056 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc1Q61056 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc1Q61056 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc1Q61056 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc1Q61056 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpc1Q61056 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc1Q61056 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc1Q61056 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc1Q61056 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpc1Q61056 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc1Q61056 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc1Q61056 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc1Q61056 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc1Q61056 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc1Q61056 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpc1Q61056 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc1Q61056 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc1Q61056 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc1Q61056 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc1Q61056 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc1Q61056 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc1Q61056 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc1Q61056 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc1Q61056 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc1Q61056 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc1Q61056 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc1Q61056 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc1Q61056 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc1Q61056 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc1Q61056 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc1Q61056 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc1Q61056 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc1Q61056 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc1Q61056 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc1Q61056 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc1Q61056 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc1Q61056 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpc1Q61056 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpc1Q61056 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc1Q61056 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpc1Q61056 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trpc1Q61056 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc1Q61056 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc1Q61056 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpc1Q61056 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpc1Q61056 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpc1Q61056 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpc1Q61056 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc1Q61056 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc1Q61056 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpc1Q61056 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpc1Q61056 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpc1Q61056 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc1Q61056 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc1Q61056 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc1Q61056 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc1Q61056 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc1Q61056 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc1Q61056 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc1Q61056 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc1Q61056 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc1Q61056 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc1Q61056 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc1Q61056 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc1Q61056 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc1Q61056 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc1Q61056 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc1Q61056 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpc1Q61056 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc1Q61056 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc1Q61056 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc1Q61056 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc1Q61056 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc1Q61056 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms