Protein–RNA interactions for Protein: Q60676

Ppp5c, Serine/threonine-protein phosphatase 5, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp5cQ60676 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp5cQ60676 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp5cQ60676 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp5cQ60676 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp5cQ60676 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp5cQ60676 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp5cQ60676 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp5cQ60676 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp5cQ60676 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp5cQ60676 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp5cQ60676 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp5cQ60676 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp5cQ60676 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp5cQ60676 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp5cQ60676 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp5cQ60676 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp5cQ60676 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp5cQ60676 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp5cQ60676 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp5cQ60676 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp5cQ60676 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp5cQ60676 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp5cQ60676 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp5cQ60676 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp5cQ60676 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp5cQ60676 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp5cQ60676 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp5cQ60676 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp5cQ60676 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp5cQ60676 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp5cQ60676 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp5cQ60676 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp5cQ60676 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp5cQ60676 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp5cQ60676 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp5cQ60676 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp5cQ60676 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp5cQ60676 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp5cQ60676 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp5cQ60676 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp5cQ60676 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp5cQ60676 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp5cQ60676 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp5cQ60676 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp5cQ60676 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp5cQ60676 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp5cQ60676 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp5cQ60676 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp5cQ60676 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp5cQ60676 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp5cQ60676 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp5cQ60676 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp5cQ60676 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp5cQ60676 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp5cQ60676 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp5cQ60676 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp5cQ60676 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp5cQ60676 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp5cQ60676 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp5cQ60676 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp5cQ60676 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp5cQ60676 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp5cQ60676 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp5cQ60676 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp5cQ60676 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp5cQ60676 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp5cQ60676 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp5cQ60676 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp5cQ60676 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp5cQ60676 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp5cQ60676 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp5cQ60676 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms