Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprnQ60673 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprnQ60673 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprnQ60673 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprnQ60673 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprnQ60673 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprnQ60673 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprnQ60673 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprnQ60673 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprnQ60673 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprnQ60673 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprnQ60673 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprnQ60673 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprnQ60673 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprnQ60673 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprnQ60673 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PtprnQ60673 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprnQ60673 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprnQ60673 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprnQ60673 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtprnQ60673 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtprnQ60673 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PtprnQ60673 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprnQ60673 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprnQ60673 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprnQ60673 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprnQ60673 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprnQ60673 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprnQ60673 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprnQ60673 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprnQ60673 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprnQ60673 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprnQ60673 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprnQ60673 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprnQ60673 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprnQ60673 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprnQ60673 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprnQ60673 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprnQ60673 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtprnQ60673 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprnQ60673 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtprnQ60673 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprnQ60673 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprnQ60673 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprnQ60673 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprnQ60673 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprnQ60673 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprnQ60673 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprnQ60673 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprnQ60673 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprnQ60673 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprnQ60673 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprnQ60673 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprnQ60673 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprnQ60673 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprnQ60673 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprnQ60673 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprnQ60673 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprnQ60673 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprnQ60673 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprnQ60673 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprnQ60673 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprnQ60673 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprnQ60673 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprnQ60673 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprnQ60673 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprnQ60673 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprnQ60673 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprnQ60673 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprnQ60673 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprnQ60673 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprnQ60673 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprnQ60673 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprnQ60673 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprnQ60673 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprnQ60673 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms