Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CttnQ60598 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CttnQ60598 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CttnQ60598 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CttnQ60598 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CttnQ60598 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CttnQ60598 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CttnQ60598 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CttnQ60598 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CttnQ60598 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CttnQ60598 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CttnQ60598 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CttnQ60598 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CttnQ60598 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CttnQ60598 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CttnQ60598 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CttnQ60598 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CttnQ60598 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CttnQ60598 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CttnQ60598 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CttnQ60598 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CttnQ60598 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CttnQ60598 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CttnQ60598 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CttnQ60598 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CttnQ60598 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CttnQ60598 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CttnQ60598 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CttnQ60598 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CttnQ60598 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CttnQ60598 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CttnQ60598 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CttnQ60598 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CttnQ60598 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CttnQ60598 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CttnQ60598 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CttnQ60598 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CttnQ60598 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CttnQ60598 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CttnQ60598 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CttnQ60598 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CttnQ60598 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CttnQ60598 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CttnQ60598 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CttnQ60598 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CttnQ60598 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CttnQ60598 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CttnQ60598 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CttnQ60598 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CttnQ60598 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CttnQ60598 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CttnQ60598 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CttnQ60598 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CttnQ60598 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CttnQ60598 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CttnQ60598 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CttnQ60598 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CttnQ60598 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CttnQ60598 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CttnQ60598 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CttnQ60598 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CttnQ60598 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CttnQ60598 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CttnQ60598 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CttnQ60598 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CttnQ60598 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CttnQ60598 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CttnQ60598 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CttnQ60598 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CttnQ60598 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CttnQ60598 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CttnQ60598 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CttnQ60598 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CttnQ60598 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CttnQ60598 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CttnQ60598 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CttnQ60598 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CttnQ60598 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CttnQ60598 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CttnQ60598 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CttnQ60598 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CttnQ60598 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CttnQ60598 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CttnQ60598 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CttnQ60598 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CttnQ60598 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CttnQ60598 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CttnQ60598 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CttnQ60598 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CttnQ60598 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CttnQ60598 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CttnQ60598 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CttnQ60598 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CttnQ60598 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CttnQ60598 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CttnQ60598 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CttnQ60598 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CttnQ60598 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CttnQ60598 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CttnQ60598 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms