Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arcn1Q5XJY5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arcn1Q5XJY5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Arcn1Q5XJY5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Arcn1Q5XJY5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Arcn1Q5XJY5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arcn1Q5XJY5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Arcn1Q5XJY5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Arcn1Q5XJY5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Arcn1Q5XJY5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Arcn1Q5XJY5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arcn1Q5XJY5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arcn1Q5XJY5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arcn1Q5XJY5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Arcn1Q5XJY5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arcn1Q5XJY5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arcn1Q5XJY5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arcn1Q5XJY5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arcn1Q5XJY5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arcn1Q5XJY5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arcn1Q5XJY5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arcn1Q5XJY5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arcn1Q5XJY5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arcn1Q5XJY5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arcn1Q5XJY5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arcn1Q5XJY5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arcn1Q5XJY5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arcn1Q5XJY5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arcn1Q5XJY5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arcn1Q5XJY5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arcn1Q5XJY5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Arcn1Q5XJY5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arcn1Q5XJY5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arcn1Q5XJY5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arcn1Q5XJY5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Arcn1Q5XJY5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Arcn1Q5XJY5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Arcn1Q5XJY5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Arcn1Q5XJY5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arcn1Q5XJY5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arcn1Q5XJY5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arcn1Q5XJY5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arcn1Q5XJY5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Arcn1Q5XJY5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Arcn1Q5XJY5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Arcn1Q5XJY5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Arcn1Q5XJY5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Arcn1Q5XJY5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arcn1Q5XJY5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arcn1Q5XJY5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arcn1Q5XJY5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arcn1Q5XJY5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arcn1Q5XJY5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arcn1Q5XJY5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Arcn1Q5XJY5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arcn1Q5XJY5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arcn1Q5XJY5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arcn1Q5XJY5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Arcn1Q5XJY5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arcn1Q5XJY5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arcn1Q5XJY5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arcn1Q5XJY5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arcn1Q5XJY5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arcn1Q5XJY5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arcn1Q5XJY5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arcn1Q5XJY5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arcn1Q5XJY5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arcn1Q5XJY5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arcn1Q5XJY5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arcn1Q5XJY5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arcn1Q5XJY5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Arcn1Q5XJY5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arcn1Q5XJY5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arcn1Q5XJY5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arcn1Q5XJY5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arcn1Q5XJY5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arcn1Q5XJY5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arcn1Q5XJY5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arcn1Q5XJY5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arcn1Q5XJY5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arcn1Q5XJY5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arcn1Q5XJY5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arcn1Q5XJY5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arcn1Q5XJY5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arcn1Q5XJY5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Arcn1Q5XJY5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arcn1Q5XJY5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arcn1Q5XJY5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arcn1Q5XJY5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arcn1Q5XJY5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arcn1Q5XJY5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arcn1Q5XJY5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arcn1Q5XJY5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arcn1Q5XJY5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arcn1Q5XJY5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arcn1Q5XJY5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arcn1Q5XJY5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arcn1Q5XJY5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arcn1Q5XJY5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arcn1Q5XJY5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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