Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttf2Q5NC05 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ttf2Q5NC05 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttf2Q5NC05 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttf2Q5NC05 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttf2Q5NC05 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttf2Q5NC05 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttf2Q5NC05 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttf2Q5NC05 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttf2Q5NC05 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttf2Q5NC05 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttf2Q5NC05 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ttf2Q5NC05 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ttf2Q5NC05 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ttf2Q5NC05 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ttf2Q5NC05 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttf2Q5NC05 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttf2Q5NC05 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttf2Q5NC05 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttf2Q5NC05 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ttf2Q5NC05 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttf2Q5NC05 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttf2Q5NC05 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttf2Q5NC05 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttf2Q5NC05 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ttf2Q5NC05 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttf2Q5NC05 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttf2Q5NC05 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttf2Q5NC05 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttf2Q5NC05 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttf2Q5NC05 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttf2Q5NC05 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ttf2Q5NC05 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ttf2Q5NC05 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ttf2Q5NC05 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttf2Q5NC05 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Ttf2Q5NC05 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ttf2Q5NC05 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttf2Q5NC05 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttf2Q5NC05 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttf2Q5NC05 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttf2Q5NC05 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttf2Q5NC05 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttf2Q5NC05 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttf2Q5NC05 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttf2Q5NC05 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttf2Q5NC05 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ttf2Q5NC05 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttf2Q5NC05 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttf2Q5NC05 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttf2Q5NC05 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttf2Q5NC05 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttf2Q5NC05 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttf2Q5NC05 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttf2Q5NC05 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttf2Q5NC05 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ttf2Q5NC05 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttf2Q5NC05 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttf2Q5NC05 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttf2Q5NC05 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttf2Q5NC05 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttf2Q5NC05 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttf2Q5NC05 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttf2Q5NC05 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttf2Q5NC05 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttf2Q5NC05 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttf2Q5NC05 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttf2Q5NC05 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttf2Q5NC05 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttf2Q5NC05 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttf2Q5NC05 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttf2Q5NC05 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttf2Q5NC05 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttf2Q5NC05 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttf2Q5NC05 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttf2Q5NC05 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttf2Q5NC05 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttf2Q5NC05 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttf2Q5NC05 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttf2Q5NC05 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttf2Q5NC05 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttf2Q5NC05 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttf2Q5NC05 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttf2Q5NC05 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttf2Q5NC05 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttf2Q5NC05 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttf2Q5NC05 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttf2Q5NC05 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttf2Q5NC05 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttf2Q5NC05 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttf2Q5NC05 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttf2Q5NC05 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttf2Q5NC05 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttf2Q5NC05 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttf2Q5NC05 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttf2Q5NC05 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttf2Q5NC05 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttf2Q5NC05 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttf2Q5NC05 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttf2Q5NC05 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms