Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZK1

Cep44, Centrosomal protein of 44 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep44Q5HZK1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep44Q5HZK1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep44Q5HZK1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep44Q5HZK1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep44Q5HZK1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep44Q5HZK1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep44Q5HZK1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep44Q5HZK1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep44Q5HZK1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep44Q5HZK1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep44Q5HZK1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep44Q5HZK1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep44Q5HZK1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep44Q5HZK1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep44Q5HZK1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep44Q5HZK1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep44Q5HZK1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep44Q5HZK1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep44Q5HZK1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep44Q5HZK1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep44Q5HZK1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep44Q5HZK1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep44Q5HZK1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep44Q5HZK1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep44Q5HZK1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep44Q5HZK1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep44Q5HZK1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep44Q5HZK1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cep44Q5HZK1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep44Q5HZK1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep44Q5HZK1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep44Q5HZK1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep44Q5HZK1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep44Q5HZK1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep44Q5HZK1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep44Q5HZK1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep44Q5HZK1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep44Q5HZK1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep44Q5HZK1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep44Q5HZK1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep44Q5HZK1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep44Q5HZK1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep44Q5HZK1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep44Q5HZK1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cep44Q5HZK1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep44Q5HZK1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep44Q5HZK1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cep44Q5HZK1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cep44Q5HZK1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep44Q5HZK1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cep44Q5HZK1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep44Q5HZK1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cep44Q5HZK1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cep44Q5HZK1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep44Q5HZK1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cep44Q5HZK1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cep44Q5HZK1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cep44Q5HZK1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cep44Q5HZK1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cep44Q5HZK1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cep44Q5HZK1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep44Q5HZK1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep44Q5HZK1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cep44Q5HZK1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cep44Q5HZK1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep44Q5HZK1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep44Q5HZK1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cep44Q5HZK1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cep44Q5HZK1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep44Q5HZK1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep44Q5HZK1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cep44Q5HZK1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cep44Q5HZK1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cep44Q5HZK1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep44Q5HZK1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cep44Q5HZK1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cep44Q5HZK1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep44Q5HZK1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep44Q5HZK1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep44Q5HZK1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep44Q5HZK1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep44Q5HZK1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep44Q5HZK1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep44Q5HZK1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms