Protein–RNA interactions for Protein: Q5BL07

Pex1, Peroxisome biogenesis factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex1Q5BL07 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pex1Q5BL07 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pex1Q5BL07 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pex1Q5BL07 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Pex1Q5BL07 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pex1Q5BL07 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pex1Q5BL07 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pex1Q5BL07 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pex1Q5BL07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pex1Q5BL07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pex1Q5BL07 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pex1Q5BL07 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pex1Q5BL07 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Pex1Q5BL07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pex1Q5BL07 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pex1Q5BL07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Pex1Q5BL07 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pex1Q5BL07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pex1Q5BL07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pex1Q5BL07 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pex1Q5BL07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pex1Q5BL07 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Pex1Q5BL07 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Pex1Q5BL07 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pex1Q5BL07 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pex1Q5BL07 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Pex1Q5BL07 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pex1Q5BL07 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pex1Q5BL07 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pex1Q5BL07 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pex1Q5BL07 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pex1Q5BL07 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pex1Q5BL07 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pex1Q5BL07 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pex1Q5BL07 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pex1Q5BL07 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pex1Q5BL07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pex1Q5BL07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pex1Q5BL07 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pex1Q5BL07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Pex1Q5BL07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pex1Q5BL07 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pex1Q5BL07 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pex1Q5BL07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pex1Q5BL07 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pex1Q5BL07 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pex1Q5BL07 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pex1Q5BL07 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pex1Q5BL07 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pex1Q5BL07 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pex1Q5BL07 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pex1Q5BL07 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pex1Q5BL07 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pex1Q5BL07 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pex1Q5BL07 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pex1Q5BL07 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pex1Q5BL07 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pex1Q5BL07 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pex1Q5BL07 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pex1Q5BL07 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pex1Q5BL07 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pex1Q5BL07 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pex1Q5BL07 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pex1Q5BL07 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pex1Q5BL07 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pex1Q5BL07 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pex1Q5BL07 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pex1Q5BL07 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pex1Q5BL07 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pex1Q5BL07 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pex1Q5BL07 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pex1Q5BL07 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pex1Q5BL07 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pex1Q5BL07 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pex1Q5BL07 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pex1Q5BL07 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pex1Q5BL07 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pex1Q5BL07 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pex1Q5BL07 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pex1Q5BL07 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pex1Q5BL07 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pex1Q5BL07 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pex1Q5BL07 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pex1Q5BL07 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pex1Q5BL07 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pex1Q5BL07 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pex1Q5BL07 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pex1Q5BL07 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Pex1Q5BL07 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pex1Q5BL07 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pex1Q5BL07 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pex1Q5BL07 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pex1Q5BL07 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pex1Q5BL07 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pex1Q5BL07 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pex1Q5BL07 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pex1Q5BL07 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pex1Q5BL07 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pex1Q5BL07 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pex1Q5BL07 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.8 ms