Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Itga1Q3V3R4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itga1Q3V3R4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Itga1Q3V3R4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itga1Q3V3R4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itga1Q3V3R4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Itga1Q3V3R4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itga1Q3V3R4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itga1Q3V3R4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itga1Q3V3R4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itga1Q3V3R4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itga1Q3V3R4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itga1Q3V3R4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itga1Q3V3R4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Itga1Q3V3R4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itga1Q3V3R4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itga1Q3V3R4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itga1Q3V3R4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itga1Q3V3R4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Itga1Q3V3R4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Itga1Q3V3R4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itga1Q3V3R4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itga1Q3V3R4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itga1Q3V3R4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Itga1Q3V3R4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itga1Q3V3R4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itga1Q3V3R4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itga1Q3V3R4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga1Q3V3R4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itga1Q3V3R4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itga1Q3V3R4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itga1Q3V3R4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itga1Q3V3R4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Itga1Q3V3R4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Itga1Q3V3R4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Itga1Q3V3R4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Itga1Q3V3R4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Itga1Q3V3R4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Itga1Q3V3R4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itga1Q3V3R4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Itga1Q3V3R4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Itga1Q3V3R4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga1Q3V3R4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itga1Q3V3R4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itga1Q3V3R4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itga1Q3V3R4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itga1Q3V3R4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itga1Q3V3R4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itga1Q3V3R4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itga1Q3V3R4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itga1Q3V3R4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itga1Q3V3R4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itga1Q3V3R4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itga1Q3V3R4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itga1Q3V3R4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Itga1Q3V3R4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itga1Q3V3R4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itga1Q3V3R4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itga1Q3V3R4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itga1Q3V3R4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itga1Q3V3R4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga1Q3V3R4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itga1Q3V3R4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Itga1Q3V3R4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itga1Q3V3R4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itga1Q3V3R4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itga1Q3V3R4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Itga1Q3V3R4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga1Q3V3R4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga1Q3V3R4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itga1Q3V3R4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itga1Q3V3R4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Itga1Q3V3R4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Itga1Q3V3R4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itga1Q3V3R4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itga1Q3V3R4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Itga1Q3V3R4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itga1Q3V3R4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itga1Q3V3R4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga1Q3V3R4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga1Q3V3R4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga1Q3V3R4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga1Q3V3R4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga1Q3V3R4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga1Q3V3R4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga1Q3V3R4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga1Q3V3R4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.3 ms