Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ankrd42Q3V096 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ankrd42Q3V096 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ankrd42Q3V096 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ankrd42Q3V096 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ankrd42Q3V096 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd42Q3V096 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd42Q3V096 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ankrd42Q3V096 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ankrd42Q3V096 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ankrd42Q3V096 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ankrd42Q3V096 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ankrd42Q3V096 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ankrd42Q3V096 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd42Q3V096 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ankrd42Q3V096 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ankrd42Q3V096 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ankrd42Q3V096 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ankrd42Q3V096 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ankrd42Q3V096 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ankrd42Q3V096 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ankrd42Q3V096 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ankrd42Q3V096 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ankrd42Q3V096 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ankrd42Q3V096 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ankrd42Q3V096 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ankrd42Q3V096 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ankrd42Q3V096 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ankrd42Q3V096 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ankrd42Q3V096 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ankrd42Q3V096 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd42Q3V096 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd42Q3V096 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ankrd42Q3V096 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ankrd42Q3V096 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ankrd42Q3V096 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ankrd42Q3V096 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd42Q3V096 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ankrd42Q3V096 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ankrd42Q3V096 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ankrd42Q3V096 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd42Q3V096 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd42Q3V096 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ankrd42Q3V096 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd42Q3V096 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd42Q3V096 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ankrd42Q3V096 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ankrd42Q3V096 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ankrd42Q3V096 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ankrd42Q3V096 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ankrd42Q3V096 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd42Q3V096 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ankrd42Q3V096 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ankrd42Q3V096 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd42Q3V096 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd42Q3V096 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ankrd42Q3V096 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd42Q3V096 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ankrd42Q3V096 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd42Q3V096 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd42Q3V096 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ankrd42Q3V096 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd42Q3V096 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ankrd42Q3V096 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ankrd42Q3V096 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ankrd42Q3V096 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd42Q3V096 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd42Q3V096 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ankrd42Q3V096 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd42Q3V096 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ankrd42Q3V096 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd42Q3V096 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ankrd42Q3V096 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ankrd42Q3V096 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd42Q3V096 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ankrd42Q3V096 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd42Q3V096 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ankrd42Q3V096 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ankrd42Q3V096 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd42Q3V096 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd42Q3V096 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd42Q3V096 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ankrd42Q3V096 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd42Q3V096 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd42Q3V096 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd42Q3V096 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ankrd42Q3V096 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ankrd42Q3V096 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ankrd42Q3V096 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ankrd42Q3V096 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ankrd42Q3V096 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd42Q3V096 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd42Q3V096 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ankrd42Q3V096 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ankrd42Q3V096 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ankrd42Q3V096 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ankrd42Q3V096 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd42Q3V096 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd42Q3V096 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd42Q3V096 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms