Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Skap1Q3UUV5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Skap1Q3UUV5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Skap1Q3UUV5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Skap1Q3UUV5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Skap1Q3UUV5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Skap1Q3UUV5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Skap1Q3UUV5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Skap1Q3UUV5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Skap1Q3UUV5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skap1Q3UUV5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Skap1Q3UUV5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Skap1Q3UUV5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Skap1Q3UUV5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Skap1Q3UUV5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Skap1Q3UUV5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Skap1Q3UUV5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Skap1Q3UUV5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Skap1Q3UUV5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Skap1Q3UUV5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skap1Q3UUV5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skap1Q3UUV5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Skap1Q3UUV5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Skap1Q3UUV5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Skap1Q3UUV5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skap1Q3UUV5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skap1Q3UUV5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skap1Q3UUV5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Skap1Q3UUV5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skap1Q3UUV5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Skap1Q3UUV5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Skap1Q3UUV5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skap1Q3UUV5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skap1Q3UUV5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skap1Q3UUV5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skap1Q3UUV5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Skap1Q3UUV5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Skap1Q3UUV5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Skap1Q3UUV5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Skap1Q3UUV5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Skap1Q3UUV5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Skap1Q3UUV5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Skap1Q3UUV5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Skap1Q3UUV5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Skap1Q3UUV5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Skap1Q3UUV5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Skap1Q3UUV5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Skap1Q3UUV5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Skap1Q3UUV5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skap1Q3UUV5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skap1Q3UUV5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Skap1Q3UUV5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skap1Q3UUV5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skap1Q3UUV5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Skap1Q3UUV5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Skap1Q3UUV5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Skap1Q3UUV5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Skap1Q3UUV5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Skap1Q3UUV5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Skap1Q3UUV5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Skap1Q3UUV5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Skap1Q3UUV5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Skap1Q3UUV5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Skap1Q3UUV5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Skap1Q3UUV5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Skap1Q3UUV5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skap1Q3UUV5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skap1Q3UUV5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Skap1Q3UUV5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Skap1Q3UUV5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Skap1Q3UUV5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Skap1Q3UUV5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Skap1Q3UUV5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Skap1Q3UUV5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Skap1Q3UUV5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Skap1Q3UUV5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Skap1Q3UUV5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Skap1Q3UUV5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Skap1Q3UUV5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skap1Q3UUV5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skap1Q3UUV5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Skap1Q3UUV5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Skap1Q3UUV5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Skap1Q3UUV5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Skap1Q3UUV5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Skap1Q3UUV5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skap1Q3UUV5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skap1Q3UUV5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skap1Q3UUV5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Skap1Q3UUV5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Skap1Q3UUV5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Skap1Q3UUV5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Skap1Q3UUV5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Skap1Q3UUV5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skap1Q3UUV5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skap1Q3UUV5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skap1Q3UUV5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skap1Q3UUV5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skap1Q3UUV5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms