Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem253Q3UNB8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem253Q3UNB8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem253Q3UNB8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem253Q3UNB8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem253Q3UNB8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem253Q3UNB8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem253Q3UNB8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem253Q3UNB8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem253Q3UNB8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem253Q3UNB8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem253Q3UNB8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem253Q3UNB8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem253Q3UNB8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem253Q3UNB8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem253Q3UNB8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem253Q3UNB8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem253Q3UNB8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem253Q3UNB8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem253Q3UNB8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem253Q3UNB8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem253Q3UNB8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem253Q3UNB8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem253Q3UNB8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem253Q3UNB8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem253Q3UNB8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem253Q3UNB8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem253Q3UNB8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem253Q3UNB8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem253Q3UNB8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem253Q3UNB8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem253Q3UNB8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem253Q3UNB8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem253Q3UNB8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem253Q3UNB8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem253Q3UNB8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem253Q3UNB8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem253Q3UNB8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem253Q3UNB8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem253Q3UNB8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem253Q3UNB8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem253Q3UNB8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem253Q3UNB8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem253Q3UNB8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem253Q3UNB8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem253Q3UNB8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem253Q3UNB8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem253Q3UNB8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem253Q3UNB8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem253Q3UNB8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem253Q3UNB8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem253Q3UNB8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem253Q3UNB8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem253Q3UNB8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem253Q3UNB8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem253Q3UNB8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem253Q3UNB8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem253Q3UNB8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem253Q3UNB8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem253Q3UNB8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem253Q3UNB8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem253Q3UNB8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem253Q3UNB8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem253Q3UNB8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem253Q3UNB8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem253Q3UNB8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem253Q3UNB8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem253Q3UNB8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem253Q3UNB8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem253Q3UNB8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem253Q3UNB8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem253Q3UNB8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem253Q3UNB8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem253Q3UNB8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem253Q3UNB8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem253Q3UNB8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem253Q3UNB8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem253Q3UNB8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem253Q3UNB8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem253Q3UNB8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem253Q3UNB8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem253Q3UNB8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem253Q3UNB8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem253Q3UNB8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem253Q3UNB8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem253Q3UNB8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem253Q3UNB8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem253Q3UNB8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem253Q3UNB8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem253Q3UNB8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem253Q3UNB8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms