Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc106Q3ULM0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc106Q3ULM0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc106Q3ULM0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc106Q3ULM0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc106Q3ULM0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc106Q3ULM0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc106Q3ULM0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc106Q3ULM0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc106Q3ULM0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc106Q3ULM0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc106Q3ULM0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc106Q3ULM0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc106Q3ULM0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc106Q3ULM0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc106Q3ULM0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc106Q3ULM0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc106Q3ULM0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc106Q3ULM0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc106Q3ULM0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc106Q3ULM0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc106Q3ULM0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc106Q3ULM0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc106Q3ULM0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc106Q3ULM0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc106Q3ULM0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc106Q3ULM0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc106Q3ULM0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc106Q3ULM0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc106Q3ULM0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc106Q3ULM0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc106Q3ULM0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc106Q3ULM0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc106Q3ULM0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc106Q3ULM0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc106Q3ULM0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc106Q3ULM0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc106Q3ULM0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc106Q3ULM0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc106Q3ULM0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc106Q3ULM0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc106Q3ULM0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc106Q3ULM0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc106Q3ULM0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc106Q3ULM0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc106Q3ULM0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc106Q3ULM0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc106Q3ULM0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc106Q3ULM0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc106Q3ULM0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc106Q3ULM0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc106Q3ULM0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc106Q3ULM0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc106Q3ULM0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc106Q3ULM0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc106Q3ULM0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc106Q3ULM0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc106Q3ULM0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc106Q3ULM0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc106Q3ULM0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc106Q3ULM0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc106Q3ULM0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc106Q3ULM0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc106Q3ULM0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc106Q3ULM0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc106Q3ULM0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc106Q3ULM0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc106Q3ULM0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc106Q3ULM0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc106Q3ULM0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc106Q3ULM0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc106Q3ULM0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc106Q3ULM0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc106Q3ULM0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc106Q3ULM0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc106Q3ULM0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc106Q3ULM0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc106Q3ULM0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc106Q3ULM0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc106Q3ULM0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc106Q3ULM0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc106Q3ULM0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc106Q3ULM0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc106Q3ULM0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc106Q3ULM0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc106Q3ULM0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc106Q3ULM0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc106Q3ULM0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc106Q3ULM0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc106Q3ULM0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc106Q3ULM0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc106Q3ULM0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc106Q3ULM0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc106Q3ULM0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc106Q3ULM0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc106Q3ULM0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc106Q3ULM0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc106Q3ULM0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc106Q3ULM0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc106Q3ULM0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms