Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcgf5Q3UK78 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf5Q3UK78 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf5Q3UK78 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf5Q3UK78 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf5Q3UK78 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf5Q3UK78 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf5Q3UK78 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf5Q3UK78 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf5Q3UK78 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf5Q3UK78 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf5Q3UK78 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf5Q3UK78 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcgf5Q3UK78 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcgf5Q3UK78 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcgf5Q3UK78 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcgf5Q3UK78 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcgf5Q3UK78 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf5Q3UK78 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcgf5Q3UK78 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf5Q3UK78 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcgf5Q3UK78 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcgf5Q3UK78 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcgf5Q3UK78 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcgf5Q3UK78 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcgf5Q3UK78 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcgf5Q3UK78 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcgf5Q3UK78 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcgf5Q3UK78 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf5Q3UK78 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf5Q3UK78 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcgf5Q3UK78 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf5Q3UK78 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf5Q3UK78 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf5Q3UK78 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcgf5Q3UK78 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf5Q3UK78 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf5Q3UK78 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcgf5Q3UK78 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf5Q3UK78 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcgf5Q3UK78 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf5Q3UK78 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf5Q3UK78 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcgf5Q3UK78 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcgf5Q3UK78 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcgf5Q3UK78 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcgf5Q3UK78 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcgf5Q3UK78 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcgf5Q3UK78 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcgf5Q3UK78 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf5Q3UK78 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcgf5Q3UK78 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcgf5Q3UK78 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcgf5Q3UK78 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcgf5Q3UK78 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcgf5Q3UK78 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcgf5Q3UK78 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf5Q3UK78 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf5Q3UK78 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcgf5Q3UK78 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcgf5Q3UK78 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcgf5Q3UK78 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcgf5Q3UK78 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcgf5Q3UK78 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcgf5Q3UK78 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcgf5Q3UK78 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcgf5Q3UK78 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcgf5Q3UK78 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcgf5Q3UK78 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcgf5Q3UK78 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcgf5Q3UK78 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf5Q3UK78 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf5Q3UK78 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcgf5Q3UK78 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcgf5Q3UK78 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf5Q3UK78 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf5Q3UK78 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcgf5Q3UK78 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcgf5Q3UK78 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf5Q3UK78 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf5Q3UK78 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcgf5Q3UK78 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcgf5Q3UK78 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcgf5Q3UK78 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcgf5Q3UK78 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf5Q3UK78 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcgf5Q3UK78 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcgf5Q3UK78 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms