Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpr55Q3UJF0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gpr55Q3UJF0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gpr55Q3UJF0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gpr55Q3UJF0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpr55Q3UJF0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpr55Q3UJF0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpr55Q3UJF0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpr55Q3UJF0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpr55Q3UJF0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpr55Q3UJF0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpr55Q3UJF0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpr55Q3UJF0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpr55Q3UJF0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpr55Q3UJF0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpr55Q3UJF0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpr55Q3UJF0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpr55Q3UJF0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpr55Q3UJF0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpr55Q3UJF0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpr55Q3UJF0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpr55Q3UJF0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpr55Q3UJF0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpr55Q3UJF0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpr55Q3UJF0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpr55Q3UJF0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpr55Q3UJF0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpr55Q3UJF0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpr55Q3UJF0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpr55Q3UJF0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpr55Q3UJF0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpr55Q3UJF0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpr55Q3UJF0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpr55Q3UJF0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpr55Q3UJF0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpr55Q3UJF0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpr55Q3UJF0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpr55Q3UJF0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gpr55Q3UJF0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpr55Q3UJF0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpr55Q3UJF0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpr55Q3UJF0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpr55Q3UJF0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpr55Q3UJF0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpr55Q3UJF0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpr55Q3UJF0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpr55Q3UJF0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpr55Q3UJF0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpr55Q3UJF0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpr55Q3UJF0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpr55Q3UJF0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpr55Q3UJF0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gpr55Q3UJF0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpr55Q3UJF0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpr55Q3UJF0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr55Q3UJF0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr55Q3UJF0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpr55Q3UJF0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpr55Q3UJF0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpr55Q3UJF0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpr55Q3UJF0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpr55Q3UJF0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpr55Q3UJF0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpr55Q3UJF0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpr55Q3UJF0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr55Q3UJF0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpr55Q3UJF0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpr55Q3UJF0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpr55Q3UJF0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpr55Q3UJF0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpr55Q3UJF0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpr55Q3UJF0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpr55Q3UJF0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpr55Q3UJF0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpr55Q3UJF0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms