Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pitpnm3Q3UHE1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pitpnm3Q3UHE1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pitpnm3Q3UHE1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pitpnm3Q3UHE1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pitpnm3Q3UHE1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pitpnm3Q3UHE1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pitpnm3Q3UHE1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pitpnm3Q3UHE1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pitpnm3Q3UHE1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pitpnm3Q3UHE1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pitpnm3Q3UHE1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pitpnm3Q3UHE1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pitpnm3Q3UHE1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pitpnm3Q3UHE1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pitpnm3Q3UHE1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pitpnm3Q3UHE1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pitpnm3Q3UHE1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pitpnm3Q3UHE1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pitpnm3Q3UHE1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pitpnm3Q3UHE1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pitpnm3Q3UHE1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pitpnm3Q3UHE1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pitpnm3Q3UHE1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pitpnm3Q3UHE1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pitpnm3Q3UHE1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pitpnm3Q3UHE1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pitpnm3Q3UHE1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pitpnm3Q3UHE1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pitpnm3Q3UHE1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pitpnm3Q3UHE1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pitpnm3Q3UHE1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pitpnm3Q3UHE1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pitpnm3Q3UHE1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pitpnm3Q3UHE1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pitpnm3Q3UHE1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pitpnm3Q3UHE1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pitpnm3Q3UHE1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pitpnm3Q3UHE1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pitpnm3Q3UHE1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pitpnm3Q3UHE1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pitpnm3Q3UHE1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pitpnm3Q3UHE1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pitpnm3Q3UHE1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pitpnm3Q3UHE1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pitpnm3Q3UHE1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pitpnm3Q3UHE1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pitpnm3Q3UHE1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pitpnm3Q3UHE1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pitpnm3Q3UHE1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pitpnm3Q3UHE1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pitpnm3Q3UHE1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pitpnm3Q3UHE1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pitpnm3Q3UHE1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pitpnm3Q3UHE1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pitpnm3Q3UHE1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pitpnm3Q3UHE1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pitpnm3Q3UHE1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pitpnm3Q3UHE1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pitpnm3Q3UHE1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pitpnm3Q3UHE1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pitpnm3Q3UHE1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms