Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdhd2Q3UGR5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdhd2Q3UGR5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Hdhd2Q3UGR5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdhd2Q3UGR5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hdhd2Q3UGR5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Hdhd2Q3UGR5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hdhd2Q3UGR5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdhd2Q3UGR5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdhd2Q3UGR5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdhd2Q3UGR5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdhd2Q3UGR5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdhd2Q3UGR5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hdhd2Q3UGR5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdhd2Q3UGR5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdhd2Q3UGR5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdhd2Q3UGR5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdhd2Q3UGR5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdhd2Q3UGR5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdhd2Q3UGR5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdhd2Q3UGR5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdhd2Q3UGR5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hdhd2Q3UGR5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdhd2Q3UGR5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hdhd2Q3UGR5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdhd2Q3UGR5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdhd2Q3UGR5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdhd2Q3UGR5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdhd2Q3UGR5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hdhd2Q3UGR5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdhd2Q3UGR5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdhd2Q3UGR5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdhd2Q3UGR5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Hdhd2Q3UGR5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdhd2Q3UGR5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdhd2Q3UGR5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdhd2Q3UGR5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdhd2Q3UGR5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdhd2Q3UGR5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hdhd2Q3UGR5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hdhd2Q3UGR5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdhd2Q3UGR5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdhd2Q3UGR5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdhd2Q3UGR5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdhd2Q3UGR5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hdhd2Q3UGR5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdhd2Q3UGR5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdhd2Q3UGR5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdhd2Q3UGR5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdhd2Q3UGR5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdhd2Q3UGR5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdhd2Q3UGR5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdhd2Q3UGR5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdhd2Q3UGR5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hdhd2Q3UGR5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdhd2Q3UGR5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdhd2Q3UGR5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdhd2Q3UGR5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdhd2Q3UGR5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdhd2Q3UGR5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdhd2Q3UGR5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdhd2Q3UGR5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdhd2Q3UGR5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdhd2Q3UGR5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdhd2Q3UGR5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdhd2Q3UGR5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdhd2Q3UGR5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdhd2Q3UGR5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdhd2Q3UGR5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdhd2Q3UGR5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdhd2Q3UGR5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdhd2Q3UGR5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Hdhd2Q3UGR5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdhd2Q3UGR5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdhd2Q3UGR5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdhd2Q3UGR5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdhd2Q3UGR5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdhd2Q3UGR5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdhd2Q3UGR5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdhd2Q3UGR5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdhd2Q3UGR5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdhd2Q3UGR5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdhd2Q3UGR5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdhd2Q3UGR5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdhd2Q3UGR5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdhd2Q3UGR5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdhd2Q3UGR5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdhd2Q3UGR5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdhd2Q3UGR5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdhd2Q3UGR5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdhd2Q3UGR5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdhd2Q3UGR5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdhd2Q3UGR5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdhd2Q3UGR5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdhd2Q3UGR5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdhd2Q3UGR5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdhd2Q3UGR5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdhd2Q3UGR5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdhd2Q3UGR5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdhd2Q3UGR5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms