Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA16

Spc25, Kinetochore protein Spc25, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc25Q3UA16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spc25Q3UA16 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spc25Q3UA16 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spc25Q3UA16 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spc25Q3UA16 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spc25Q3UA16 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spc25Q3UA16 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Spc25Q3UA16 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spc25Q3UA16 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spc25Q3UA16 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spc25Q3UA16 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spc25Q3UA16 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spc25Q3UA16 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Spc25Q3UA16 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Spc25Q3UA16 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spc25Q3UA16 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Spc25Q3UA16 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spc25Q3UA16 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spc25Q3UA16 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spc25Q3UA16 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Spc25Q3UA16 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spc25Q3UA16 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spc25Q3UA16 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spc25Q3UA16 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spc25Q3UA16 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spc25Q3UA16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spc25Q3UA16 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spc25Q3UA16 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spc25Q3UA16 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spc25Q3UA16 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spc25Q3UA16 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spc25Q3UA16 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spc25Q3UA16 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spc25Q3UA16 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spc25Q3UA16 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Spc25Q3UA16 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spc25Q3UA16 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spc25Q3UA16 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Spc25Q3UA16 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spc25Q3UA16 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Spc25Q3UA16 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spc25Q3UA16 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spc25Q3UA16 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spc25Q3UA16 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spc25Q3UA16 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spc25Q3UA16 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spc25Q3UA16 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spc25Q3UA16 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spc25Q3UA16 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spc25Q3UA16 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spc25Q3UA16 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spc25Q3UA16 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spc25Q3UA16 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Spc25Q3UA16 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spc25Q3UA16 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spc25Q3UA16 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Spc25Q3UA16 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spc25Q3UA16 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spc25Q3UA16 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spc25Q3UA16 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spc25Q3UA16 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spc25Q3UA16 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spc25Q3UA16 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spc25Q3UA16 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Spc25Q3UA16 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spc25Q3UA16 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spc25Q3UA16 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spc25Q3UA16 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spc25Q3UA16 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spc25Q3UA16 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spc25Q3UA16 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spc25Q3UA16 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spc25Q3UA16 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spc25Q3UA16 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spc25Q3UA16 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spc25Q3UA16 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spc25Q3UA16 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spc25Q3UA16 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spc25Q3UA16 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spc25Q3UA16 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spc25Q3UA16 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spc25Q3UA16 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spc25Q3UA16 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spc25Q3UA16 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spc25Q3UA16 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spc25Q3UA16 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spc25Q3UA16 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spc25Q3UA16 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms